Basic Information

Symbol
hsa_SHPRH_0012100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SHPRH_0054
Host gene
SHPRH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
6:146256216-146271584 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:145935080-145950448 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-544.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -584.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 597.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((...(.(((....))).)...)))..)))((((((.......((((.(((((..(((((((....(((((....)))))...(((((((...((((((.(((.(.((............)).).)))..)))))).))))))).........)))))))...(((((((((((((.(((((((((...)))))).))))))).)).))))))).(((((((((((..((..(((((((((..((((((....((.(((.(((....)))))).))...((((((.(((..((((((..((((((((((..(.((((....(((((((((((((((.((((...((((((.((((.((((((((.....((.....)))))))((((...)))).(((((.((((....)))).))))).((((......))))((((((((......(((((....(((.......)))..................((((((...........))))))...))))).....))))))))..((((((((((..((..((((.((.((((............)))))).))))..))....))).)))))))((((....)))).....(((((....))))).(((.(((((((((.....((......)).....))))))))).)))..))).)))))))))).)))).)))))))))))))))...))))..)..)))))).(((((((((((.....(((......)))........((((((((((((.(....((...((((((..................((((((((........((((.((((((.(((((((((....)))))))(((((((((((.......)))))))))))........((....))))))))..)).)))).....)))))))).(((.........))).............((((((.....(((((((((.(((((((((.(((.(((((((((((.(......).)).))))))).)).....((((((.((.((((((..((((..........)))).))))))))))))))...............)))))))))))).)...............((.(((............))))).....(((((((.(((((((((.(((.....(((((.....)))))...))).)))))....((((...((......))..)))))))).))))))))))))))).))))))......))))))..))..).)))))))))))).....((((((((((((.((....)).)).))))))).)))..((((...(((((((((...((((.(((....))))))))))).)))))...))))..(((((((..((((((((((((..(((((......)))))..))))))..)))))).))))))).)))).)))))))((((.(((...(((((.((....)).))))).))).))))..........................))))..))))))........(((((...))))))))..))))))..(((((..((((......)))).....))))))))))))))))))))..)).))).........)))))))))))))))))(((((..((((.((((((....))...)))).)))).))))).......(((((((((..((((.(..((((.(..((((((((((((.(....(((((.((((.((((((((((((....((((((((..(.((((...)))).)..))))))))(((((....(((.....)))..)))))......(((.((((((((((..((........))..)))))))))))))..))))))).((.((((.....))))))......))))).)))).)))))...).)))).)))...)))))..).))))..).))))..)).))))))).))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({.{{({{{(.((,....|||{|{.{|||,.||}(({{(({...,,,,||,.|||||..,....||,|{{((({{..,,))))),..(((((((...((((((.(((.(.((,.{......,,.)}.).)))..)))))).))))))).......{{{{((,((((((((((((((((((.,({((((((...)))))).,,,)))).}).))))))}...,,{.((((((.((,.(((((((....((((,....{((((,(,((..{{{|,,{{.{{{(.,,,,|}}|{{||,|,,,|,.}))))}||||,,}}..}))))))}}|||||}}},,||,))))))).})},)))))),,,}}))),,.}},))){{{{...}))).((({...}))).{((((.((((....)))).))))|.((({......))}}|||||{{,{{{{{{(((,,....(((.......}}}...}}}}}}}}}..,...((((((...........)))))},,}))))),.,,,}||||}}|..{((((({{{{{{{{.,({{{,(.{((((,...,{(((...,,,.))})))))))},,|,}}|.}}}}}}}((({....}|||.....{((((....}}}}}.,.})}},}}}|,,,|||,|}}||.||||||...,,.{((((((((((.(((,.,(((((.......)))))))))))))))))))}{{(((({{{{{.,,,{(({({.{{.{{.....{((......}}}.....,,,(((((({(((((,,...,({...((((((......,,.,....,,,,((((((((........((({.{{({{{{(((((((((....))))))),,{,{(((,,({{{.,,,,||||,,,})).},,..}}}}...})))))))}.,}},))}}.....)))))))).{((.........)))............{{{.((,,{{..((((((({(.(((((((({{(((.,{(((((((((.(......).)).))))))).},.....((((((.((.((((((..((((..........)))).))))))))))))))...............)))))))))))).}...............{{.{((............}}}}}.,,,.(((((((.{((((((((.(((..,,.,((((.....))))),..))).)))))....{(((...,{,.,,..,}..)))))))}.)))))))))))))))..)))}},,....))))))..}}..,,)))))))))))),},,}}|))}}}}|,,..((((.(((((({,,,.|{{{,...((((((((.(((((,.....(((({,.((.(((((.(((({({{|,|,|,..,|{{,.{(((((({.((((((((((((..(((((,....,)))))..)))))}.,)))))).,,,,,},,)))}|},,||||{{{{.,{{{{{(,((({(({{{{,,.,,)))})),})))}}}}}.,.........{{{{|,.|{{{|{||,||....,,))),)))}||||}}.}}}}.,,}..||,,.,|||||...,}}))})))...)))).))))).)).)))))(((.(((((....((((((((({..((,{{..{{(((({..{((((((..((((.(((({,....,}...)))).)))).)))))))}}}))),)))).)))))).))))))))).)))})))),))))))))..}}||{((,((((.((((((((((((,{,.((((((((.{(,((((...)))).)}})))))))}.(((({{..(((.....)))..)))))},....{((.((((((((((..{(..,.....)),,)))))))))))))}.})))))),{(.((((.....))))))....,.})))).)))).}}}}...})))))).)))},}}))).})))))}},}},))))))}.})))})))}}})}),)
Forensic Context

No forensic context available.