Basic Information

Symbol
hsa_SHPRH_0013900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SHPRH_0043
Host gene
SHPRH
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
6:146268629-146273059 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:145947493-145951923 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-168.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -180.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 184.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(..(((((..(((...((((((((((........))))))....)))))))(((((..(((((.(((((((......))).)))).))))).(((......))))))))(((((((((((.((((...(((((((((......((((.......))))(.(((((((..(((...(.(((....))).)...)))..))))))).)......))))))))).........(((((((((((....)))))...(((((((...((((((.(((.(.((............)).).)))..)))))).)))))))......((((.(((((((((((((((((((((.(((((((((...)))))).))))))).)).)))))))...........)))))))).)).))..............)))))).(((....)))...((((.....))))..))))..)))))).)))))......)))))....).))(((((.((((..((((((((((((.((.(((((((...............))).)))))))))))).))).))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,.{((((({{((,,.((((((({{{,.{,{,...}))))|,.,{{{,,,,,(((((..(((((.(((((((......))).)))).))))).(((......))))))}}..,,,||||{({((((,..{((((((((,.....((((.......)))){.(((((((..(((...{.(((....))).}...)))..))))))).}....}.)))))))))}},.}},..||}||||{{||,...))))},..(((((((...((((((.(((.(.((,.{......,,,)).).)))..)))))).))))))).......,{{||{{((((((((((((((((((.,({((((((...)))))).,,,)))).)).)))))))...,}|,||{{|||||,}||||.((,..,(((({.....(((({(.{(,....}}}...((((.....))))..))))}},,,,,)))))})},}}),}})))}}}}}.))((({{.{{{|.|||||||,{|{{||||,|{{{|||}.,.....,,.|,|.})},)))}}})})))),))}.))))))}.)))))
Forensic Context

No forensic context available.