Basic Information

Symbol
hsa_SHPRH_0014000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SHPRH_0109
Host gene
SHPRH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
6:146268629-146273614 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:145947493-145952478 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-203.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -216.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 217.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.........(((((..((.(((((.((((.....))))..(((((((((.......)))))))))((((....)))).)))))))..))))).((((((((((..((...))..))))))))))(((((.(......))))))....((((((((((........))))))....))))))(((((((.(((((.(((((((......))).)))).)))))..((......))((..(((((((((((((.((((...(((((((((......((((.......))))(.(((((((..(((...(.(((....))).)...)))..))))))).)......))))))))).........(((((((((((....)))))...(((((((...((((((.(((.(.((............)).).)))..)))))).)))))))......((((.(((((((((((((((((((((.(((((((((...)))))).))))))).)).)))))))...........)))))))).)).))..............)))))).(((....)))...((((.....))))..))))..)))))).)))))))..))((((((((.(.((((((....((((((.(((....((..((.......))..))..))).))....))))...)))))).)))))).))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({,,,..(((((..(,{(((({.((((.....))))..(((((((((.......)))))))))((({....}))).,))))))..))))).{(((((((((..({...})..)))))))))}|({((,{,.,{{{{{{{.|||,{((((((((((........)))))}..,,||}}}}{((((({,(((((.(((((((......))).)))).})))).(((......)))|,}||,,{{{||||{({((((,..{{{({({({,,....((((.......)))){.{((((((..({{...{.({{....))).}...)))..)))}}}},|....,.}})))))))}|..},,..|||||||{{{{....)))}|,..(((((((...((((((.(((.(.((,.{......,,.)).).)))..)))))).)))))))...,,..,{{|||{(((({(((({{{{||||{,|||((((((...))))))....)))).)),)))))),,,.}}}}{((({(.{{|,(((((((....{(((,....{((({|{,((..{{,|,.{,.((((.....}))),,||}}..}},}})})))}}}}..}}.,}})}}}}|,||||||,,..|||})))))}.,}},)))))},}}}))))}..}..|||{||{,,,}|}}.{{||.,,)))),,))}))))}}))))
Forensic Context

No forensic context available.