Basic Information

Symbol
hsa_chr11_0430300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC22A6_0010
Host gene
SLC22A6
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
11:62729799-62730946 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:62962327-62963474 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-374.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -397.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 268.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((((((((((((((.((((((.((((((((((((((((((((.(.(((...((((.((((..((((((((((((((...........(((((.....(((((((...(((.....))).((((((((....))))..)))).((((((...((((((.(((((((((.((((((((........))))).......))).)))))))))..))))))......)))))).((((((((..(((((((....(((((...((.(((..((((.((.((...(((((..((((.(((((.(((((........((((......))))..(((((.......(((....))))))))..))))).))))).))))..))))).)).)).)))).))).))...))))).)))))))..)))))).)).............(((.....))).(((((((...(((((((...))))).))((((.(((((....))))).)))))))))))(((((......)))))...))))))).(((......)))..))))).....))))))))))))))..)))).))))...))).))))))))))))))))))))).)))))).)))))))))))))))))).)))))(((.((....)).)))......((((((((((((..((((..((((((((((((((((.((.....(((.(((((((((...........))))).....)))))))..........((((((((.(((.(((....((((....)))))))...))).)))).))))........(((((.......((((((...(((.(((((((((((...((....))...))))))).)))))))....)))))).........))))).....((((.........)))).((((((.(((..((((...))))..))))))))).........(((((((((((((......)))).(((((((........)))).))).....((((((...)))))).....))))))))).)))))).))))))..))))))..))))................((((((...))))))..........)))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.((((((((((((((((((.((((((.((((((((((((((((((((.(.(((...((((.((((..{(((((((((((((,,,........(((((.....(((((({,,.(((.....))).{((({(({.,,{||,|,,)))).((((((...((((((.(((((((((.(((((((...(,,...,.))}..}}}}}))).)))))))))..))))))......)))))).{.{{{({{..{((((((....(((((...((.(((..((((.((.{{.,.(((((..((((.(((((.(((((...,{{..{(((......))))}}|(({.......,(((,...,}}}))))..))))).))))).))))..))))),)).)).)))).))).)}...))))),))))))}..}))))).}),|...||{{{,,|(((,....))).||,,|||},.,,{((((...))))),|}{(((.{((({....))))}.)))),,,}}},(((((......)))))...})))))).(({......})}..))))).....))))))))))))))..)))).)))).,.))).))))))))))))))))))))).)))))).)))))))))))))))))).)))))..,.{(({{{{....)}.})))|{((((((((((..((((,.(((((((((((((((({((,,,..((,,({,{((({,.....,.....,}}}}.,|{,||||||.,,,,,.,,..((((((((.(((...{..,.((((....)))),)....))).)))).)))).......,{((((,{.....((((((...(((.{({,(((((((...{(....})...))))))).,)),)))....)))))).....,,,.))))}.......,{|||,,,,,.,}||,|,{{|{.{{,..{({{...,|||{,|,}}}})))})}....,}|||,,{({{{.{{..{,,,|}}},||||}}|,.....,,|}|},||||{...,,{{||..,)))))}.....,})))}))),,,))))}}))))}.,))))))..))))................{(((((...))))))..........))))))))))),.
Forensic Context

No forensic context available.