Basic Information

Symbol
hsa_SLC8A1_0024500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0120061 hsa_circSLC8A1_010
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:40655714-40656626 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40428574-40429486 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-257.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -276.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 222.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((((((((((((((.((((((......(((((...((((..((((((((((....((((.........((((.((....((((.((((((...((((...(((((((...((((.((((.((((.......)))).))))..)))).........((((.((.(((.(....).))).)).))))...(((.(((......)))..))).....)))))))....))))....)))))).))))....))..))))..(((((((((((......(((..((..(((((((......(((((((............))).))))..(((((((....(((.((((((((((..(((.......))))))))).))))....))).....)))))))(((((..(((.(((((((...((((...))))..))).)))).))).)))))..........((((((....((((......))))...))))))..)))))))..)).)))......)).)))))))))))))...)))))))))).((((....)))).))))..)))))......((.(((((.....(((......)))..((((((((((....(....)....))))))))))...........))))).))(((((........)))))(.((.((.(((..((((((.....((((((((....)))))))))))))).))))).))))))))).)))))....)))))))))(((((((((((((((.(((((.(((...((((......))))....((((((..((((((....)))))).)))))).(((((....))))).))).)))))...))))))..........))))...))))))))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((((((((((((((((.((((({.,{.(((((({.{{(,,{.{((((({((((....(({,.........|{{{.||,,,|||||,{{||||||||||{|,.,.{{{{,,..||,(((((((.((((..,..((((((.....,...{((....,..((((.((,({(.,....},})),)}.))))..,....))}...}.....))))))..}..)))).))))))).,....))))}}.|||||}|,||,,||||,.{((((((((((.....{(,,{{((..(((((((......,|,.{{,(((((.....{{{{{.{{....)}}}}},..))))).((((((((((..(((.......))))))))).)))).,,{{{{,,{{{|,.{|||(((((..(((.(((((((...((((...))))..))),}))).))).))))).,}}..,,..((((((....((((......))))...))))))..)))))))..)).)),.,.,,.))}}))))))))))}}...}}}}}}}|||.((((....)))).)))}..}},}}....,.|},,}}},,}}.}|||},},.,}}|{,((((((((((....{....)....))))))))))}}{{..{{{{||,.{{((((((((........))))),,.|.|}}}}}..}|||}}..,,{((((((((....)))))))))|||,,.,,,...))))))))).)))))....))))))))){((((((((((((((.(((((.(((...{,{{......||||....((((((..((((({....}))))).)))))).{{|||..,,))))).))).)))))...))))))..........))))...))))))))))))......
Forensic Context

No forensic context available.