Basic Information

Symbol
hsa_SLC8A1_0001700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0037
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:40342512-40401982 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40115372-40174842 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-265.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -284.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 204.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.