Basic Information

Symbol
hsa_SLC8A1_0011700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0057
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:40505303-40505910 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40278163-40278770 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-183.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -194.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 110.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(.(((((..(((((((((((...((((((((((((..(((..(((((((...(((.(.((((..(((((((...((((((((.......(((((((.((..((((...................))))..)).))..)))))))))))))))))))).)))).)...)))..)))))))..)))..(((((((((....)))))))))..........(((......))).......((((((...))))))))))))))))))...))))))))))).....))))).).((((..(.(((((((((((((...))))))))..((((((((.((((((.((((((....((((.....))))....))).....((((.((((..((....((((((..((((((((......)))))..(((((((.(.(((.((((..(..(((((...........))))).)..))))))).))))).))).))).)))).)).....))..)))))))).........(((((((.(...(((((......)))))...)))))))).))).))))))))))))))............))))).).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(.(((((..(((((((((((...(((((((((((({.(((..(((((((...(({.{.((({,.(((((((...((((((((.......(((((,{.((..((((.{........,.......,))))..)).}}..)))))))))))))))))))).)))).}...)}}..)))))))..))),.{{{{(((((....}}}})))}}.....,,,,,{({......}}}.......((((((...))))))))))))))))))...))))))))))).,,,.))))).}.((((..{.(((({((((((((...)))))))),{((((((((.((((((.((((((....((((.....))))....))).....((({{{(((..,,....{{{{{{..{{{{{{{{..,,,{||||}..,{{((((.{.{{|,||{{.}|},||||{...........}}}}},|,|||||||}.|}|||.|}}.}}}.)))),)).,,,,)),,))}))))}...,.....(((((((.(...(((((......)))))...)))))))).))).)))))))))))))).,..........})))),}.))))
Forensic Context

No forensic context available.