Basic Information

Symbol
hsa_chr2_0767500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0152
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
2:40566866-40567910 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40339726-40340770 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-293.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -313.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 201.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((((.((((.(((((((.((((((...))))..((((((.....((((((......))))))..))))))..........((((((...))))))........((((...(((((((.((((((((.....((((((.....((((((((.....))))))))((((.(((((........)))))....))))(((........))).............)))))).....)))))))).......(((((..(((((...((((((((((((((.((((((....))))))..)).))))(((((....)))))......................))).)))))))))).)))))................((((((..........)))))))))))))..))))...(((((((.......(((((((((.(.....).))))))))).....)))))))...........))))))))).)))).))))))..((((..(((((((((((.........)))))).).))))))))(((..((((((((..((((((((.(((((.....((((.(.((((((....))))))..).)))).......))).)).)))))....))).))))))))))).......))(((((((((..((..............((((((((((.((((.....))))))....))))))))(((((....)))))((((((((....((((((((((((((.(((((..((((((..((.........)).))))))))))).)(((.....)))........((((((((.........))))))))....((((...((((..(((.(............))))..))))..)))))))))))))))))........((((((((.(((....)))))))))))(((....))).....(((((((..(((((((((...)))).)))))....))))))).......)))))))).........))..))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((((((.((((.(((((({,(({{,,...||||..{(((((...,.(((((,...,,,))}}))..))))))..........((((((...))))))........,{((,..,{{{,||.{(((((((.....{(((({.....((((((((.....)))))))){(((,(((((........))))}....)))|(((........))).............)))))).....)))))))}.,,,,,,((({(,,({{{(,,.{({((((,.{{|||,((((((....)))))},{||,||||,,,{,....})))),,,},,................|||||}))}}}}}|,}|}}},,,,,...........((((((..........)))))))))))})}})))),||,||||||.......(((((((((.{.....}.))))))))).,,..))))))},..........})))))))).)))).))))))..((((..(((((((((((.........)))))).),})))))))(((..((((((((..((((((((.{((((.....((((.(.((((((....))))))..).)))).......))).)).)))))....))).))))))))))).......))(((((({((,,((..............(((((((({(.((((.....))))})....))))))))(((((....)))))((((((((....((((((((((((((.(((((..((((((..((,,....,,.)).))))))))))).)(({,,,..}}).,}.,,.(((((((((.........))))))))}}..((((.,.{(((.,(((.{..........,.,))),.)))),.))))))))))))))))),,,.,,..,{|||||,.{((.{{{{{{|......))))))).}},.....(((((((..(((((((((...))))},))))....)))))))...,,},)))))))).....,...)).,))).))))))
Forensic Context

No forensic context available.