Basic Information

Symbol
hsa_chr2_0767900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0223
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
2:40580863-40581717 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40353723-40354577 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-209.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -227.10 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 245.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...............((((((((...(((.(((.(((((..(((.....(((((((.......(((.((((...)))))))((.(((((((.(((..............(((((....)))))..))))))))))))...(((.((((((((((((((.....(((..(((.....((((((....))))))..((((.(.(((((..(....((((((.......((((....(((((((.....)))((((((...))))))....)))))))).(((((((...((((((..........))))))..)))))))((((..((...(((((((....))))))).....))..)))).........(((.....(((((...........))))).....))).))))))..........((((((...............)))))))..))))).))))).)))..)))..)))))).)))))))).))).)))))))......((((......))))...........((((((((((((...................((((((......(((((((((.............)))))))))((((((.....))))))(((.(((((.....))))).)))......))))))))))))))))))..(((((((((((.(((((((...(((...((((((.(((....))).))))))...)))...))).....)))).).)))))).))))..)))..))))).))))))...))))))))........((((((((.(((...(((((((..((......))..))))))))))..)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
........{{.....((((((((...(((.(((.(((((..(((...,,(((,(((,,,....,((,((({..,|||}...||,|,{{(((.{{(,,....,,,,,...(((((....)))))..}))))}))|||||,.,,,.{(((.(((((((((((.,{{....}}|.....((((((....))))))..))))))))))).}}}}...,|,||.,,,,{,.,{({.,,,(((((,,.,,,,|||((((((...}))))).,..|}}},|}},{((((((...((((((..........))))))..))))))},,,{.,({...(((((((....))))))).,...|,..,,,,........,,||,....{{{{,..,........}}}}}...,,.,,.}}|}}}..,.....,,{{{{{{.....|||,......}})))},,,}}},,,}}..,.,|,,|}}}..)}}))}}},..,,,.})}}}))))}})...,,.{{||..,.,,|{{{,....}}))}}(((((((((((({...,.,,,,,,.......,|||||,,,...(((((((((..,..........)))))))))((((((.....))))))(((.(((((.....))))).)))......,},,,)))))))))))))..{{{{{{{{{,,,{{{,{,|,,,({(((.{{{{{{,|||,,..))),)))))}.},)}},))))...,,}))))))))))))}))}},..)))..))))).))))))...)))))))).,......((((((((.({{.,,(((((((..((......))..)))))))})},.)))))))).
Forensic Context

No forensic context available.