Basic Information

Symbol
hsa_chr2_0770000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0158
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
2:40627787-40628685 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40400647-40401545 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-221.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -239.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 216.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((((((((((.(((.....)))...))))))).....((((((((.((.(..((((((((((.((..(((((........)))))...((((((...)))))).......(((((((((....((((((.(((..(((.(((((.(..(((((((....((((...))))(((....)))(((.((((.((((.(......).)))).)))).)))........)))))))(((((((((((.(((((((.......((((......))))...........((((((((((((((((((....((..((((..........)))).))..((((((((((((...((((.(.(((....(.((((((...(((((((((((((..((((((.((((.(((((..((((.(((((((............))))))).))))(((((.........(((........)))..........)))))......)))))))))))))))..))))))................((((((.((......((((...))))(((((........)))))..(((......)))........)).)))))))))))))....)))))).).....))).).)))).)))))))).))))((((........))))...)))))))).........))))).))))).....))))))....).)))))))....))))..).))))).))).)))))))))....))))))))))).))))))))))..).)).)))))))).....................)))))).))))((.....................(((((((....))))))).(((((((...)))))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((({.{{,.,,{{{|,,,({{{{.,|{,..,|||{{|((({,((((((((.((.(..((((((((((.{{..{((((........))))}..,((((((...)))))).......(((((((((....((((((.(((..(((.(((((.(..(((((((....((((...)))}(((....)))(((.((((.(((({{....,.),)))).)))).))).....,..)))))))|,,,(((((((.{((((((....,,,((((......))))...,,,.....{(((((((((((,((((({,.,((..({((,...,.....))))|}}..((((((((((((...((((.{.(((.,,,(.((((((...(((((({((((((..((((((.((((.(((((..{(((.(((((((............))))))).)))}((((,..,,,,...(((........))).......}}}))))),.....)))))))))))))))..))))))..,{,....{{{....||||||}||...,.{((({...})))|{(({........}}}},..,,,....,.,||,........}.)})))))))))))....)))))).,..,,,)}).).)))).)))))))).)))),{{(,,,.....}))),..})))))),))}....}}))))).))))}..,..))))))....}.)))))))..,,|,,,..),))))).))).)))))))))....)))))))))}).))))))))))..).)).))))))))......,,..............)))))}))))|,,,...}}}..}}}}},,....|{(((({....)))))},.(((((((...)))))))...}}
Forensic Context

No forensic context available.