Basic Information

Symbol
hsa_SLC8A1_0022500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0202
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:40655613-40656640 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40428473-40429500 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-283.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -305.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 302.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((((((.((((...((((((((((((((.((((((......(((((...((((..((((((((((....((((.........((((.((....((((.((((((...((((...(((((((...((((.((((.((((.......)))).))))..)))).........((((.((.(((.(....).))).)).))))...(((.(((......)))..))).....)))))))....))))....)))))).))))....))..))))..(((((((((((......(((..((..(((((((......(((((((............))).))))..(((((((....(((.((((((((((..(((.......))))))))).))))....))).....)))))))(((((..(((.(((((((...((((...))))..))).)))).))).)))))..........((((((....((((......))))...))))))..)))))))..)).)))......)).)))))))))))))...)))))))))).((((....)))).))))..)))))......((.(((((.....(((......)))..((((((((((....(....)....))))))))))...........))))).))(((((........)))))(.((.((.(((..((((((.....((((((((....)))))))))))))).))))).))))))))).)))))....))))))))))))))))))((((((.(((((.(((...((((......))))....((((((..((((((....)))))).)))))).(((((....))))).))).)))))...))))))...............(((((((((.(((((..........(.(((((((.....((.((((((...((.((..........)).))..)))))))).....))))))).)))))).)))))).)))......))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,{.{{{,{{{({{{{.(((({{.(((((({{{(((((.((((((.,{.{{(((({.{{(,,{.{((((({((((....(({,.........|{{{.||,,,|||||,{{||||||||||{|,.,.{{{{,,..||,(((((((.((((..,..((((((.....,...{((....,..((((.((,({(.,....},})),)}.))))..,....)))...}.....))))))..}..)))).))))))).,....))))}}.|||||}|,||,,||||,.{((((((((((.....{(,,{{((..(((((((......,|,.{{,(((((.....{{{{{.{{....)}}}}},..))))).((((((((((..(((.......))))))))).)))).,,{{{{,,{{{|,.{|||(((((..(((.(((((((...((((...))))..))),}))).))).))))).,}}..,,..((((((....((((......))))...))))))..)))))))..)).)),.,.,,.))}}))))))))))}}...}}}}}}}|||.((((....)))).)))}..}},}}....,.|},,}}},,}}.}|||},},.,}}|{,((((((((((....{....)....))))))))))}}{{..{{{{||,.{{((((((((........))))).,.|.|}})}}..}|||}}..,,{((((((((....)))))))))|||,,.,,,,,.))))))))).)))))...,)))))})))}||||||||((((((.(((((.(((...{,{{,,,.,,|||{....((((((..((((({....}))))).)))))).((({{...,))))).))).)))))...))))))..........,,,..,,{((((({,{({{(....,.....|,{(({{{{.....((.(({{{(,..{{.||...,,,,,..)).}),.))))))))...,.))))))}..))))).})))})},}},},...})),
Forensic Context

No forensic context available.