Basic Information
Symbol
hsa_SLC8A1_0022700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0281
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:40655613-40657107
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40428473-40429967
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-431.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-460.34 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
587.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..((((((.............((((...........)))).((((((..((((.(((.(((.((((.(..((.((..(((((((((...((..((.((((((..((((((..........(((((..((((((..((((....((((((((....))).))))))))).)))))).)))))))))))..)))))).))..))((((((...(((((((.....)).)))))..((((((.(((((.(((((((((...(((..(((((((((((...((....))..)))))))))))........(((..((.(((((.(((..(.(((((((((.(((((((((((((.((.((((((((((((....(((((...((((((((......)))))))))))))....)))).((.((.((((((((.....)))))))).)).)).............((((.(((...))).)))).(((((((..((((....((((.((((.((.(((((((.(((....((((((.((((....(............)....)))).))))))..)))))))))).))))))))))......)))))))))))...))).))))).)).))).))))))))))..))))))))).)......))).))))).))..)))..)))...)))..))).))).)))))...)))))).........((.((((...(((....))).)))).)).))))))....((((((.(((...(((((......)).....(((((.....(((((.((....)))))))..))))).((((((((((..(((.......))))))))).)))).((((((((((....(((((((((..(((.(((((((...((((...))))..))).)))).))).)))))..........((((((....((((......))))...))))))...((((......)))).)))).....))))))))))............(((.((((....)))).))).))).)))..))))))..)))))))))(((......)))..((((((((((....(....)....))))))))))(((((....)))))...(.(((((........))))).)((.((.(((..((((((.....((((((((....)))))))))))))).))))).)))).))..).))))))).)))))))....)).))))((((((.(((((.(((...((((......))))....((((((..((((((....)))))).)))))).(((((....))))).))).)))))...))))))........))))))...(((((((.(((((..........(.(((((((.....((.((((((...((.((..........)).))..)))))))).....))))))).)))))).))))))).))))))(....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((..(((,..,,....||.....((((...,...,,,.,}||.,.,.(((,({{(......{{.{((,,{(({,,,....||},)))}.,}||.,||}||,|||,,(({((({{{{{{,{{,{{{{{,.{(((((..(((,...{((((((((....))),})))))))).)))))}.|||||||||||{,||||||,||,.||||{{{{,{{{,.,{{{,{(({{(({{{{{(,({{{{{|{{,{,,{{{{{{{{{,,{{{{,.(((((((((((...((....))..))))))))))),,{,{,{{(({{{,({(,,,.}|||,.,.{{{|||{{{.(({{{{{{{|{||,||.,((((((,.,.,...,||||||.,((((((((......})))))},,.||}|||||,{{{((.((.((((((((,....}}}}}}}}.}}.})||||||,..,||,|{{{,|{{.,.}}),)))}}}||},|}}}|}))))}}}|}|,|||,.,{.|||||{,.|||..,,{((((({((((....({,,.........|{,{.||,,.}||}}}.,|}|}}}}}}},},.,,|}}}}},}}}||||||||,{||,..},,,}}}}|.}}.}}},,}}}}}}}}}.,|||}||}|},,......}))}}))}}}))..}}}..}}}..,)}}..}))}))).,},,},,,,}}}}}}}||....,,}}}}.||||,||,{|,,||||,.{((((({{(({....,{(,{{{({..{{{{{{{......|}|,||.{{({{.,,,.{|||{.||,...}}}}}},..)}))).{(((((((((..(((.......))))))))).)))}.|||{{{{,{{{{..{|||(((((..(((.(((((((...((((...))))..))),}))).))).))))).,}}..,,..((((((....((((......))))...))))))..}||||}}..}},)),.},,,.}}},}))))))))}||..,|}}}}},|||.((((....)))).))),..,,.,,...,,.}}},))}}}}},}|||},}...))|,.((((((((((....{....)....)))))))))),|||,.||||||,.{{{{(((((({,,..,,,|||}|{.{{.||}|||..|||||,...,(((((((((....)))))))))|{({...{(((({|.......))))))}....))),,,||(({{{{{((((((((,({{{{,({{...,.,{,,{,{{||||..,.((((((..((((({....}))))).)))))).{{{||..,,)))}).})).)))))}},)))))),),.,},.}}}}}..,.|||||||}||||||||||,,,,,),}}}},.......{|.||||,|},.||.|},,,)))))})))}))}})))))))).,..,)))))}},,}}},,.))))))).)))))){....)
Forensic Context
No forensic context available.