ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_SLC8A1_0001100
Basic Information
Symbol
hsa_SLC8A1_0001100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0014
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:40342512-40366816
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40115372-40139676
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-168.80
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-177.96
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
115.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((((((.((((.(((....((((.(.((((.((.....)).)))).)...))))....))).)).))))))))..(((..(((((((((((.......))))))....(((((((((((..(.(((((((..(((.(((.......(((((((.....((((..(((.........))).))))))))))).(((((..((((((((.(((((...(((((((((....(((((((((.(((....)))..))))))...)))...)))).))))).......)).))))))))))).)))))....(((((((...((..((((((((.((((..(((((((..((......)).))).))))...)))))))...))))).)))))))))...(((((..........)))))..((((((((.((((...(((((((...)).)))))))))))))))))))).)))....))))))).)..)))).....)))))))..((((((...))))))....)))))..)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((((((.((((.(((..{{{(({.{.((((.{(.....)).)))),}..,})))....))).)).))))))))..(((..(((((((((((.......))))))....(((((((((((..(.(((((((..(((.(((.......(((((((.....((((..(((.........))).))))))))))).(((((,,(((({(((((((({...{((((((((..,.(((((((((.(((....)))..))))))...})),,.)))).))))).......}),,)}))))}|||,|||}}....(((((((...((..((((((((.((((..(((((((..((......)).)))},)))...)))))))...))))).)))))))))...|||||,,........))))),,|||||(|{,({{,...{((((({...)),))}}},})},}}}}}}}))).)))....))))))).}..)))).....))))))).|(({(((,..}))))).,,})))))..)))..
Forensic Context
No forensic context available.