Basic Information

Symbol
hsa_SLC8A1_0009900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0253
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:40490223-40492288 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40263083-40265148 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-566.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -607.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 415.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.