Basic Information
Symbol
hsa_SLC8A1_0011600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0264
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:40505303-40505907
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40278163-40278767
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-181.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-192.68 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
122.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((((((((((...((((((((((((..(((..(((((((...(((.(.((((..(((((((...((((((((.......(((((((.((..((((...................))))..)).))..)))))))))))))))))))).)))).)...)))..)))))))..)))..(((((((((....)))))))))..........(((......))).......((((((...))))))))))))))))))...))))))))))).....)))...))((((..(.(((((((((((((...))))))))..((((((((.((((((.((((((....((((.....))))....))).....((((.((((..((....((((((..((((((((......)))))..(((((((.(.(((.((((..(..(((((...........))))).)..))))))).))))).))).))).)))).)).....))..)))))))).........(((((((.(...(((((......)))))...)))))))).))).))))))))))))))............))))).).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,(,..((((((((({(.,.(((((((((((({.(((..(((((((...(({.{.((({,.(((((((...((((((((.......(((((,{.((..((((.{........,.......,))))..)).}}..)))))))))))))))))))).)))).}...)}}..)))))))..))),.{{{{(((((....}}}}))}}}.....,,,,,{({......}}}.......((((((...))))))))))))))))))...))))))))))),,,,}.)){{,|,{{{(,,{.,,,{{((((((((...)))))))),{((((((((.((((((.((((((....((((.....))))....))).....((({{{(((..,,....{{{{{{..{{{{{{{{..,,,{||||}..,{{((((.{.{{|,||{{.}}},||||{...........}}}}},|,|||||||}.|}|||.|}}.}}}.)))),)).,,,,)),,))}))))}...,.....(((((((.(...(((((......)))))...)))))))).))).)))))))))))))).,..........,,)))}}.))))
Forensic Context
No forensic context available.