Basic Information

Symbol
hsa_chr2_0769800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0126
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
2:40619341-40620153 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40392201-40393013 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-167.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -184.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 188.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((.............(((((.......((.(((((.(.(((.((((((..((......))..))............(((((((((.((...((((((.....(((.....))).(((((...(((((.(((...(((((....((......)).....).))))...))).)))))....))))).((((((((..(((((((((..............))))))))).)))))))).......(((((..((((((((........)))))))).))))).......((((((((...((((...))))((((....))))(.(((((((......))))))).)......)).)))))))))))).....)).)))))))))......))))))).).))))).)).......)))))....(((((((((((((((.....(((((..(((..((((((((((((..((((.(((((((...........((.(((((.(((......))).))))).)).....(((............))).))))))).))))..))).....)))))))..))..))))))))))))))))...(((((((((......))))))))).........)))))))...........)))))).)).....((.(((((((...(((...(((((((.....(((((.((....))...)))))))))))).(((((.(((....)))...))))).((((..(((((((((....)))))))))..)))))))...))))))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,{{,.{(({{..,({{..(((,{{(({{{{({.,,,....(((((((.(({,((((({..{{..,,..))............(((((((((.((...{{{{{{.....(((.....))).(((((...(((((.(((...((((,,..,{(......||.....).))))...))).)))))....))))).((((((((..(((((((((..............))))))))).)))))))).......,,{{{..((((((((........)))))))).,}}||......,{{{(((({..,{{((.,,|||,,{{|,,,,})),{.(((((((......))))))).}......}).))))))))}))).....)).)))))))))......))))))).))))))}.,,.......}})))....(((((((((((((((.....(((((..(((..{{((((((({{{..((((.(((((((.,..,,{.{{((,{(({({.(((.{{..,|,,.,}},,,,},}.,,|,|.,,..,,,,...,))}))))))).))))..,}}.....))))))),}),,.))))))))))))))))...(((((((((......))))))))).........)))))))...........}))))).))}.,))}.,))}))))}.,(((((.(((((((.....(((((.{,....}}...)))))))))))).{{{({,(({....))).,,}}|||.((((..(((((((((....)))))))))..)))).},.))))).,.......
Forensic Context

No forensic context available.