Basic Information

Symbol
hsa_chr2_0771200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0251
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
2:40657349-40679142 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40430209-40452002 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-94.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -103.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 69.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.................((((......))))(((((((..(((((.........)))))(((.((......(((((........)))))......)).))).(((((((((((((.(((.(((((......))))))))..)))).))))))))).........))))))).((((((((((.......................((((....))))................................(((((((((((.((.((((((.((((((......)))))).))..)))).)).)))).))))))).(((((((.(.....).)))))))(((((((.(((((((.......))))))).....((((.(((.....))))))))))))))....................))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.,...,||........{{{{......}}}{(((((((,,(((((.........))))),|{.((,{,...{((((........)))))}}}}..,,.}|,.(((((((((((((.(((.(((((......))))))))..))))},))))))))...,,....)))))))}((((((((((.......................((((....))))......,.........................(((((((((((.((.{((((,.((((((......}))))).,).,))))})..)))).))))))).,((((((.(.....,,))))))|(((((((,(((((((.......))))))).....{(((.(((.....)))))))))))))),...................))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.