Basic Information
Symbol
hsa_SLC8A1_0015900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0228
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:40554298-40555014
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40327158-40327874
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-162.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-177.29 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
173.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((.(((((.....(((...))).......((((((.......))))))..))))).)))).)))((((((.....((((((((((((...(((((...........((((....))))....((..(.((((.............)))).)..))...............((((((..(((.(((((((.((((.....(((((((..(((.......(((((.(((...)))..))))).....((((.(((....))).)))).......(((((((((......((((((((.(.((((((..((((.((((......................)))).))))......(((((....))))).(((.((.(((((((((((((((((.......((.((((((.((..(((((......((((((.((((((.((((......))))...)))))).))))))(((....)))...........(((((((..(((((((((((....(((.....)))..)))))..))))))..))))))).........)))))..)))))))).))......)))))))...)))))...))))))).)))..)))))))))))))))...)))))).))).)))..))))))).....)))).)))).))).)))..)))))))))))..))))))))))))..))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({.({((.(((((.....(({...}))...,{..((((((.......))))))..))))).)))}})))({((({...,.((((((((((((...(((((...........((((....))))....,,,,{.{(((,......,,....})))..,}}},},}}.,..,,....((((((..(((.{((((((.((((.....(((((((..(((,,....,(({{{.,{{...}}}|,)))))..,,.((((.(({....})).))))...,},,|||{{{{{({{,.,.((((((((.(.((((((,.((((.((((......................)))).)))).,,,,.(((((....))))),|{{,({(((((((((({{{(((((......,||.((({((,{(..{{{{|,,.,,.((((((.((((((.((((......))))...)))))).)))))),((,,{{|{{{.....}}}}}}||||{{..(((((((((((....(((.....),),,)))))..))))))..)))))}},...,,,,,||}}}..}}}}}}}}.}}.....,))))))),..})))),..)))))},.,,,..}))))))))))))))...))))),.}}}.)))..))))))).....)))).}))).))).)))..)))))))))))..))))))))))))}.)}))).)
Forensic Context
No forensic context available.