Basic Information

Symbol
hsa_SLC8A1_0022800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0027
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:40655613-40657110 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40428473-40429970 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-430.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -458.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 593.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((.((((((.((((..(((....(((((.((((((..((((.((((((((((........((((.((((.(((........))).))))...((..((.((((((..((((((..........(((((..((((((..((((....((((((((....))).))))))))).)))))).)))))))))))..)))))).))..))..(((..(((..((((((((..((((((.(.(((((((((....(((((((((((((((..(((((((((((...((....))..)))))))))))(((((.((((.((.(((....))).....)).))))..(((......))))))))..((((((.........)))))).((((((((..................))))))))...((.((.((((((((.....)))))))).)).)))))))))......(((....)))...))))))))....)))..)))))).).))))))...))))))))..)))..))).((((.(((.............)))))))))))....))))))...))))..))))....))))))..)))))..)))..)))).)))))))))))((((((((((((((.((....(((((((((((...(((((((((((.((..(((.(((......)))..)))..............(((((((.....)))).)))......)))))))).)))))((.((......))...))........((......))..))))))).........))))..)).))))))...((((((.((((.((...(((((.((..((((.((((.((((((.((((.((((((..(((..((.............(((((((.(((((((((((((((.(((((...((((((..(..(((((((((....((((......))))...)))))).........)))..)..))))))))))).)))..)))))...)))))))(((.((((....)))).)))...........)))))))))..)))..))))))...)))).))((((((((....(....)....))))))))........((((((..((((((((((........)))))......)))))..))))))...((((((((((....)))))))))))))).)))).))))..)).)))))...)).)))).))))))))...)))))).(((..((((..........((.((((((.(((((((((..((((((....)))))).)))))).(((((....))))).....))))))))).))))))..)))........(((((((((.(((((..........(.(((((((.....((.((((((...((.((..........)).))..)))))))).....))))))).)))))).)))))).)))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((..((({,.,,....||.....((((...,....,,.,}||.,.,.(((,({{(......{{.{((,,{{({,,,....}}},)))}.,}||.,||}||,|||,,(({((({{{{{{,{{,{{{{{,.{(((((..(((,...{((((((((....))),})))))))).)))))}.|||||||||||{,||}|||,||,.||||{{{{,{{{,.,{{{{{(({{(({{{{{(,{{{{{{,{{,{,,{{{{{{{{{,,{{{{,.(((((((((((...((....))..))))))))))),,{,{,{{(({{{,({(,,,.}||{,.,.{{{|||{{{.(({{{{{{{|{||,||.,{(((((,.,,,...,||||||,,((((((((......))))))},,,||}|||||,{{{((.((.((((((((,....}}}}}}}}.}}.})||||||,..,||,|{{{,|{{.,.}}),)))}}}|||,|}}}|}))))}}}|}|,|||,.,{.|||||{,,|{{..,,{((((({((((....({,..........|{,{.||},.}}|})}.,|}|}}}}}}},},.,,|}}}}},}}}||||||||,{||,..},},}}}}|.}}.}}),,}}}}}}}}}.,|||}||}|},,......}))}}))}}}))..}}}..}}}..,)}}..)))}))).,},,},,,,}}}}}}}||....,}}}}}.|||,,||,{|{,||||,.{((((({{(({....,{(,{{{({..{{{{{{{......|}},||.{{({{.,,,.{|||{.||,...}}}}}},..)}))).{(((((((((..(((.......))))))))).)))}.|||{{{{,({{{..{|||(((((..(((.(((((((...((((...))))..))),}))).))).))))),,}}..,,..((((((....((((......))))...))))))..}|}|}}}..}},)),.},,,.}}},}))))))))|||..,|}}}}},|||.((((....)))).))),..,,.,,...,,.}}},))}}}}},}|||},}...))|,.((((((((((....{....)....)))))))))),}||,.||||||,.{{{{((((((,,,...,,}}})|{.{{.||}|||..|||||}...,(((((((((....)))))))))|{{{...{((({||,......})))))},...))),,,||((({{{{((((((((,({{{{,({{...,.,{,,{,{{||||.,,.((((((..((((({....}))))).)))))).(((|{..,,))))).})).)))))}},)))))),),.,},.}}}}}..,.|||||||}||||||||||,,,,,),}))}........{|,||||,|},.||.}},},)))))))))}))}}}))))))).,,.,)))))}}},}}},,.))))))).))))))......
Forensic Context

No forensic context available.