Basic Information

Symbol
hsa_SLC8A1_0022900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0033
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:40655613-40657308 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40428473-40430168 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-487.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -520.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 630.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.((((...(((....(((((((....((...(((((((..((((((.(......).))))))....(((....)))..((((((((......))))))))........((((..(((((..........)))))..)))).((((.(((((((((.((((((((((....)))).((.......))(((..(((.((....)).)))..)))...........((((...........))))))))))..)))))).)))))))..))))))).))....)))))))...)))..))))...((.((.(((.((((((((..((((((......))))))....(((((((((....))).))))))..))))))))))).)).))((((((..((....)).))))))))))..(((..((((((((((((((..(((((.(((((.(((((((((...(((..(((((((((((...((....))..)))))))))))........(((..((.(((((.(((..(.(((((((((.(((((((((((((.((.((((((((((((....(((((...((((((((......)))))))))))))....)))).((.((.((((((((.....)))))))).)).)).............((((.(((...))).)))).(((((((..((((....((((.((((.((.(((((((.(((....((((((.((((....(............)....)))).))))))..)))))))))).))))))))))......)))))))))))...))).))))).)).))).))))))))))..))))))))).)......))).))))).))..)))..)))...)))..))).))).)))))...)))))))))).....(((((((((..((((...((((((((((.((.((......))...))........((......))..(((.((((.....((((((.((.((((((((...((((((.((((.((...(((((.((..((((.((((.((((((.((((.((((((..(((..((.............(((((((.(((((((((((((((.(((((...((((((..(..(((((((((....((((......))))...)))))).........)))..)..))))))))))).)))..)))))...)))))))(((.((((....)))).)))...........)))))))))..)))..))))))...)))).))((((((((....(....)....))))))))........((((((..((((((((((........)))))......)))))..))))))...((((((((((....)))))))))))))).)))).))))..)).)))))...)).)))).)))))).....((((((((.(((((.(((...((((......))))....((((((..((((((....)))))).)))))).(((((....))))).))).)))))...)))))).)).....(((((..(.....)..))))).)))))))).))))))))........((((...((.....))...)))))))).))))))))..)))))....))))..))))..)))))...)))))))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,(((.(.(.((((((((({..((((({....}}}}}|.|},,...(((.((((({{..(((({{{{{{(((....)))..((((((((......)))))))).}}}}}}}||},..(((((........,.)))))((((,,...}}}||}}||||,}||,{{,{{{{,...|})}.}}{({{{,(((((,..(((.(({((({|.{{{...,.....,,....,((({...,.....,.}}))|||,|(({{|,|||.,.},||,{{{{,||{........))),)))}..|{{,,((,(({{{(,,(((((((({{{{{{,.{((((..{(((({..(((,...{((((((((....))),})))))))),)))))).|||}|||||||{.||||||,||,.||,{((({.{{{..,{{{{{{{,,{{{{{{|{,({{{{{|{{,,,,|||||{{{|||||||,,(((((((((((...((....))..))))))))))),,{,|,||(({{{,(((....}})|}.,.||{||||{{.(({{{{{{||{||,||.,((((((,.,.,...,||||||.,{(((((((......})))))},,,|}}|||||,{{,((.((.((((((((.....)))))))).}}.}),|||||,..,||,|{{{,|{{,,.,})})))})}|}}.}}}},}))))}})|)},}||..,|,||||||,.|||..|,|((((({((((....{{,,.........||,{.||,,.}}|})}.,|}|})}}}}},},.,,}})}}},}}}}|||||||.||||..}}}|}}}}|.}}.}}),,}}}}}}}}}.,||}}||}||{,......,)))}))}}}))..}}}..)}}.,})}},,)})}))),.,..,,,,.}}}||||||,...,,}}}}.|}},,||,{|{.||||..{(((({{{((,....,{(,{{{{,..,,,{,||......}}},||.||{{{.|},,|||||.||}...}},}}},..}}))).((((((((((..(((.......))))))))).)))},|||||||.{{{|..{|}}(((((..(((.(((((((...((((...))))..))),}))).))).))))),,}}..,,..((((((....((((......))))...)))))).,}}}}},,..}||}},,|,,,.})}}})))))||||||..,|,}},,,|||.((((....)))).)))...,,.}}...,,.))}}))},}}},}|||},,,..}}},.((((((((((....{....)....)))))))))),),))})))).})),|}})))}}})}}..,})))))).).).))}}}(((((.(((...((((((((((....)))))))))).(({.((((((.........,((((({((..,{..,,(((((((((((((((((((.,,,{{{,..,,.,{{((,((({((.((,((((((..((((({,...|)))}}.)))))).(((((....))))).,,,.}))))))}),))))}},.}}}.,,{{,..,.{{{{{{{|||||((,,,{{....)}))))........,|,}}},,)),.}}.}))),)))))))))}}))},))))))).}},.)))))))),,..}..)))))).))).))).)))))
Forensic Context

No forensic context available.