Basic Information

Symbol
hsa_SLC8A1_0026900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLC8A1_0196
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:40695327-40696863 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40468187-40469723 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-333.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -365.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 333.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((..........(((((.((......((((((((.(((.....)))..))).....))))).....)).)))))...............(((((..(..............................)..)))))(((((((.((((.......(((((.((((((.((((((....((.((((((((((((...((((.......).))).....(((((((..((((((.....))))))...)))))))..(((.((((((((((.(((((((((((((..((.........(((((.(((((((((........).)))))....))).))))).((((((.((.((((((((((((((((.....))))))....)).))....)))))).)).(((......(((((((.......)))))))......))).)))))))))))))))))((..(((((((((((((((((((((..(((....(((......)))...((((((((.((((.((((((.(((.......((((((((((.......).)))))))))........(((((..........)))))....(((((((.......((((((((..((((....((((((....)))))))))).....)))))))).......)))))))((((((((......((((.........(((((...)))))))))....))))))))))))))))).)).............)).))))))))..(((((((((((.((((((.(((((......(((((((((((...))))..))))))).(((((....(((((((.((....((((((....(((((..(((((((((((.(((....((((((.........(((......))).))))))..)))..)))))...........).))))).)))))...(((.((((((..((((......(((...((((((((...))))))))..)))........))))...)))))).))).....((((((((..((((((((.((.........)))))).))))..))))))))...((((((((....)))).))))...)))))))).)))))))...)))))........))))).)))))).(((((...))))).......))))))))))).)))..)))))))))).))))).........))))))..))..((((((((((.......)))))))...)))...(((((((....(((((.......))))))))))))................(((((.(((.(((.......))).))).)))))))))))).))))))).))).))..)))))))))).)))))))))))))))))))....)))).)))))))....................((((((....))))))(((((((...(((((((((....))))))))).)))).)))))))))...((((((.....))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((..........(((((.({......((((((({.(((.....)))..))).....))))).....)).))))).,,,....,}}...,(((((..(.,,..,{{..............,,,...,.)..)))))|((((((.((((.......(((((((((((,,((((((....((.((((((((((((...,,||,,.....}.}},.....(((((((..((((((.....))))))...)))))))..(({.((((((((((.(((((((((((((..((.........(((((,(((((((((........}.)))))},,.|)),)))}).{(((((.({.((((((({((((((((.....)))))),...}}.}}....)))))).)).|{{..,...(((((((.......)))))))...,..}},.)))))}}})))))))))|{..{((((((((((((((((((((..(((....,{,{({{..{....}.,||||{{.{{,{,({{(((.({(|{{{{..((((((((((.......),}))))))))..,||,..{((((..........))))}......,{{{{.,,,,,,((((((((..,,,(,...((((((....)))))),))).....))))))))......|)))))||,,.....|}}}.,,..,||||,,.,,.(((((...}))))|,,.,,,,,}}}}}}.,}}}))))}.,,,....,.,..,,,}}.})))}}|{{{(((,,((((((,{(((((,(((((,...,,||||{|||||{.,.}}}|,.}}}||||.(((((..,.(((((((.{(.,,,((,(((,...(((((..(((((((((((.(((....((((((......{{.(((...,,,,)).))))))..)))..)))))...........),})))).)))))...(((.((((((..((((..,...(((...((((((((...))))))))..))).....}}.)))}...)))))).)))..,,.((((((((..((((((((.((.........)))))).))))..))))))))...|||,||||,.,})))},,}}}...}}}}}}}).)))))))...))))),,,,...,},}}.,}}}))},.}}}}},.,||||,,,,.,,},}}))))))},}))..))))))))))}})))).........))))))..}},,|({(((((((.......))))))),,||}|...(((((((....(((((.......))))))))))))................{((((.,((,(({.....,.))),)}}.)))))))))))).))))))).))).},..}))))))))).)))))))))))))))))))....)))).))))))}.............,....,.{(((((....)))))}{(,((((...(((((((((....))))))))).)))).)},))))))...((((((.....))))))
Forensic Context

No forensic context available.