Basic Information

Symbol
hsa_ARHGAP19-SLIT1_0003400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLIT1_0056
Host gene
SLIT1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
10:98808712-98821787 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:97048955-97062030 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-566.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -602.10 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 480.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((......))).((((((((.(((((((((((..(((((......)))))....)))))......((((((......(.((((((((....((((..(((((((((((........))))).))).)))))))...)))))))).)..((((((((((((....((((((...((((.((((.(((.((((((((.((((.......(((.(((.((...........))))).))).....)))).))))(((((((((......((((...(((((......)))))....))))(((((((((((((((........((((.............))))....)).))))))..((((((((...)))).))))...........)))))))..........)).))))))).((...(((...(((((...)))))...)))...))......((((((((((((((((((....))))).))).))))..(((((....)))))..........)))))).)))).))))))).))))((((.((((.((.(((((((.((((((.((((((((((((..(((...((((((...(((((((((((((.......))))).))))).))).))))))(((((...((((.........))))...)))))........((((.((((((((..((((((((((((...........((((.((.((..((((((((.(((.(((((((.(((((.((((((......(((((...)))))......)))))).)))))....(((((..((..(((((((((((.(((.......))).))))))))))).)).)))))((((((((((((...)))).......(((((((.......))))))).))))))))......))))))).))).)))...))))))))).))))..........)))))))))))))))))))).)))).((((((.(((....((((...((((((....((...))....))))))...))))))).)))))))))...))))).))))...............(((......)))......))).)))))).))...))))).)).)))).))))))))))....))))........))))))))(((..(((((((((.((((((((((....))......((((..(((.(((......)))(((((((((((.(((((..((((((((((((.((....(((....(((....)))...)))..)).))))))).))))).....((((((((.((((((((((((....(((......(((.....)))......))).....)))))))))......((..(((((((...(((.(((.(((.((((.(((.(.(((.((((........)))).))).)))))))).))).)))((((...((((....))))..)))).......))).....(((((((((..........((.....(((.....))).....))..(((.(((........))).))).)))))))))..........))))))).))))))).))))))............(((((......)))))))))).)).))))))))).........(((((..((((......)).))....)))))...)))..))))......))))))))..))))...)))))..)))..))))))(((((.........))))).(((.........)))))))))))))))))(((.(((((....((((((...))).)))((((((.(((((..((....((((...)))).))..))))).))))))......((((.....)))).))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((......}}),((((((((.(((((((((((..(((((......)))))....}}}},.....,|||{((.....{(((((((((({.......(((((((((((((........))))|{||,,|||{||...,|(((({.,....(((((((((({{....,,{((.....}},.{(((((((....))).))))}..((((((((((..(((((...(((((((.,.((((((((.,({(((...|||,||{,((((((({.....}}}})))}.,.....,,,,..,{|,,,}}||{{{{,.....{{{((...,|||,,.},.((((({{{.((((((........,{,.((((((((...))))},)))...{{{....}}}...........,,.,{({,.,,{.,.,.....,.))}.|||{{{{{|{||{{.......{{......||,,,,(((((({(((((....))))).))).))))..(((((....)))))...,}.,,))))))),......,.,,,...)))))).)).)))))),.}))))}.))))))..}}.,,..))),..}))).}))))....))))...))))))}))))))))).....))))).||{(({,..,,,,((({{...})))}.....})))))),.,)))}.....((((.((((((((..{(((((((((((.....,,,...((((.((.((..(({{{{{{.{{,.{{{{{{{.(((((.((((((......(((({...}))))......)))))).)))))....(({,,..{|,.(((((((((((.(((.......))}.))))))))))).,,.}}}}}((((((((((({...}))),....{.(((((((.......))))))),))))))))......)))}))}.}}}.})}...}}}}})))).})))...,.....,)))))))))))})))))))).)))).{{((((.,,,.({{((((...((((((....((...,,..,,))))))...)))}})))))))))))))).))}.))))))))))}}...,.}}},{{,......},}..,,|||},,..{{{{|{{...,.,,...,,})}),..,,||||||,..,,,..............,,{,(({..(((((((((.(((((((((,.,.{{{....,,({,,({(({..........|||{((((((((((.(((((..(((((((((({{{{,...,||{,.,,||{,...(((....))}.||,|},||||,,}||}.....((((((((.((((((((((((....(((......(((.....)))......))).....)))))))))......((..(((((((...(({.(((.(((.(({({(((.(.(((.((((........)))).))).)))))))).))).)))((((...((((....))))..)))).......}}}.....(((((((({......{...,,..,|.(((.....)))..,,.},,,(((.(((........))).))).}))))))))......,...))))))).)))))}},})))))...........,||||{.},},.)}}))))))).)).))))))))}........,|||||,.,|||......,},.}....}),))|},}|,..}))),....)))))))))..))))}..,))))..))),.}})))|(((({.........}})))}{{{,......,.}))))))))))))))))(((.(((((....((((((...))},)))((((((.(((((..((....((((...)))).))..))))).))))))......((((.....)))).))))).)))
Forensic Context

No forensic context available.