Basic Information
Symbol
hsa_SLIT1_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLIT1_0032
Host gene
SLIT1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:98761067-98762705
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:97001310-97002948
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-226.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-235.50 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
117.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........(((.(((((((....((((((((......((((((..((......))..)))))).(((((.(........).)))))((.((.((((((...(((((.(.....(((((((.((......)).)))..))))....))))))...)))))).)).))(((((((.(((((((((.(((((((..((((......))))..).)))))))))....((((........))))...)))).)).))))))).....(((((((.(((.((((..((((...((.......)).)))).))))..)))))))))).))))))))))))))).)))((((.((((((((((.(((((((((((((((.....)).))))).))))))))..)))((....)).(((((.....))))).(((((((..(((((((..(((.....)))....))))))).)))))))((((...))))))).))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((..((((((((((((((((((((,(.{(((((,((((((..((......))..)))))).{{(({.,.....,,.}.}|}||{{..,{.(((((((.(((((((........)))},))},......,((((.(((.((((((((,(({..(((((((((((((......))).))).).)).))))}}|((((((.,(,,....}.,}}))))))....((((((.(((.(((.((({{{.|{|{{,|.(((({....,|||||,.,||}||.|}.,,,,...(((.{{{{{{{{,,,,.,)))}}),)),)))}}})))...)))))).))))))))))))))))).))))(((((((((((((((.....))},))))},))))))).))))))).,((({(((((.....))))).))))}}},))))))),}))))))).)),....}).))).)))))).))))}....,){.{{,.......}).)
Forensic Context
No forensic context available.