Basic Information

Symbol
hsa_chr10_0584000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SLIT1_0020
Host gene
SLIT1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
10:98806278-98808627 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:97046521-97048870 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-550.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -576.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 283.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((..(((.((((((..(((((..(((.((((.((((((((((((.....)))))))).........)))).))))(((((((((((((((..(((..(((((.(((...((.((((.((..((((((((((((((..((((((((....((((((((.(((((..((((.(((...))).)))).)))))))).((((((((((.......)).)))))))).....(((((.(..........(((((((.(.....).)).))))).(((......)))(((((.(((.....))).)))))...).)))))(((((.(((((.....((((.....)))).....))))))).))).)))))))))).)))..)))))))).))))((((((...))))))...(((((..(((.(((((((((((((....((((.......))))))))))))(((.(((((((((((.(((.(...(((((.((((.((..((.....(((((...(((((((........(((............))).....)))))))(((..(((((.(((((((...(((((..(((((((((...))....((((((((..(((((((((.((((.....)).))))).))))))((((((..(((((((..(((.........)))..)))))))...))).)))..))))))))(((..(((((..(((((((.....))((((((.......((((......))))...)))))))))))...))))))))..........)))))))..))))).((.((((((((.((.....(((.((..((..(((.........))).))..))))).....)).)))))))).))...............))))))).)))))))).....((((((...(((((((((..((((.((((((.((...)).)))))).)))).......((((((((...............((((....((((.....((((((..((.(((......))).))..))))))...))))....))))((((...((((((......))))))))))(((((......))))).))))))))...(((.((((((((.((......)).)))))))).)))....((((....))))))))))))).)))))).....((((((...))))))((..((((........))).)..)).....))))).....))..)))))).)))))..).))).)))))).)))))...))).).)))).))).)))))))..)))))).))...)))))))).)))))))).))))))))))...)))..)))))..)))))).)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
,...{,{{.||((.((((((,.(((((..(((,{(((.((((((((((((.....))))))))}}},,,,.,|}||,||||{((((((((((((((,,(({,,(({(({((({,.(({(((({(,...(((((((((((((..((((((({...,((((((((.(((((..((((.(((...))).)))).)))))))).((((((((((.......))}}))))))).....{((((.,....{{{,..(((((((.{.....).)).))))),|||......,,,(((((.{((,...,))}.)))))...}.))))|(((,(.(((((.....((((.....))))...,.))))),).))),)))))))))).)))..)))))))),})))|,,{|}}}})))))},,,(((((..(((.((((,((((((((....((((.......))))))))))))(((.(((((((((((.(((.{...(((((.((((.{{..{{.....(((((((((,,,,,,..}}}}..|||}...,{{{....|||.....||||||.(((..(((((.{((((((..{(((((..(((((((,....,,.,..((((((((..(((((((((.({{{.....}}.)}))).))))))((((((..(((((((..,,,{{{{.....)))}})))))))...))).)))..))))))))(((..(((((..(((((((.....},((((((.......((((......))))...)))))))))))...))))))))........,,)))))))..))))}.((.((((((((.((.....(({,((..((..(((.......,,))).))..))))).....)).)))))))).))..........,}}..))))))}.)))))))).....((((((...(((((((((..{{{{.((((((.(,...,).)))))).}|||{({,...((((((({.......,,......,(((,,..((((.....((((((..((.(((......))).))..))))))...))))....))))|(((...((((((......)))))))))}(((((......))))).})))))))...{{{.((((((((.((......)).)))))))).}},....,|||}},,}}},))))))))).)))))).....((((((...)))))),,.}||||}.......,,,.}..))}....))))|{{...}}.,)))))).)))))..}.))).))))))),))))...))}.,.)))).))).)))))),.})})))).))...)))))))).)))))))),))))))))))),,)))}}),)))}.)))))).))}))))..,
Forensic Context

No forensic context available.