Basic Information

Symbol
hsa_SMARCA5_0005100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0071046 hsa_circSMARCA5_010
Host gene
SMARCA5
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:144459939-144468061 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:143538786-143546908 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-239.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -260.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 264.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.....(((((((...((((..((((((...((.(((((.......))))).)))))))).))))....(((.......))).(((((....)))))....)))))))(((((((((((((((((........((((((((((((((((((.((.((......)).)).((((.....)))).....((((.(((......((..((......))..)).......))).))))((.(((((......)))))))))).))).))))))..(((..((((((.(((((((..((((...)))).....((((((....(((((..(((((...(((((..((.((((((((.((....)))))))))).......))..)))))((((......((((((((((((.((((.......((((........))))(((.(((((.....((((........))))....))))))))....((((.((..((....))..)).)))).((((((.((((......))))..))))))...........((......))..((.((((......))))))................))))..))))))))))))......)))).)))))..)))))(((((.((.(((..........))).)))).)))...........))))))((((((((((((...((((((..((((.((...........)))))).)))))).((((((...))))))........((((((...)))))).))))))))))))(((.....))).))))))).............((((((..........))))))..))))))..)))))))))((((((((...........))))))))...))))))..)))))))))))........(((((...(((((....)))))..))))).)))))))).(((..(((((.((.......(..(((...............)))..).........)).)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.....((({(((.{,((((..((((((...((.(((((.......))))).)))))))).))))},,,(((.......))).(((((....)))))..,,||}}}}}(((((((((((((((((...,,.,.{(((({{,((((({,,,,,{{.||},}..{||{|,.{{{{....{|||},{{{(({{,,}||}}...,|}}.....,{|{|....,....,||}}}....,{{.(((((......)))))}}|}{{{{{{..{{((.(((.....|}}|}})),,))))}},{,,{(({{{{{..,(((((.....{({{..,{||||..{{......|.|((((((({{....})}}})))))}..,,..,|{{.,.,))||,,,|,,|.((((((((((((.((((.......((((........)}}}(((.(((((.....((((........))))....))))))))....{(({.((..((....))..)).}))).||{{{{.((((......))))..}}}}}}.............,}},,})}..{(.((((......))))))................))))..))))))))))))......}}}{((|{((.{{{.((((({{.....}},.,))))..}}))))))).},..,,,.......))))))}}|||||||||{,,||||{{{,.{{{{.{{,,....},,,.}})))).},}},,.{(((((...)))))}......,,((((((...))))),,)},,,||||,(((((.....))))).)))),.............((((((..........))))))..}}}}}}..}}.}}}}},((((((((...........))))))))...))))))..))))))))))).....,,,||,,....(((({....}))))..,,,,..)))))))).(((..(((((.(,.......{..{{{..{{.....,,....)))..,......},.}}.}))}}))).
Forensic Context

No forensic context available.