Basic Information
Symbol
hsa_SMARCA5_0004500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0071044
hsa_circSMARCA5_007
Host gene
SMARCA5
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:144457605-144465125
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:143536452-143543972
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-216.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-232.13 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
211.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((..(((((.......))))).)))))))(....((((((((((((((.......(((.(((..((((.(((((...((((((..........(((((((..(((((((...(((((((((((((...((((.(((((.......((((((....)))).))..(((....)))......)))))..)))).....)))))))....)))))).((((...))))....(((.((((((((....(((((.(((.....)))..)))))..)))))))).))))))))))...)))))))..))))))....))))).))))..))).)))((((.(((......))))))).((((...(((.((.(((..((((((...((.(((((.......))))).)))))))).))))))))))))..)))))))..)))))))((((((..((((((((..((((..((.(((...(((.....(((((((..((.((((.(((((((((....((((.....))))..((((.((((((...))))))...)))).....(((((..........))))).....((.(((((......)))))))..((((((..((((.(((.....))).))))..))))))...((((...((....))....))))....(((((((..((......)))))))))....))))))))).)))).))...((((....))))..))))))).....)))...))).)).))))))))))))...))))))(((.(((((.....((((........))))....))))))))....((((.((..((....))..)).)))).((((((.((((......))))..))))))...........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,(({({{{((,((,,,,,,.,||||{||,,|||(,...((((((((((((((.{.....{((.(((..((({.(((((...((((((.{{{{..,{{,((,,.,}},,|||.|}}},{{{{{(((((((...((((.(((((...,,,.,,((({....}))).}},.(({....}))......)))))..)))).....)))))))....}|}},,.,|||...,{{((((.(((.((((((((....(((((.(((.....)))..)))))..)))))))).))).))))))....,,,,,,..))))))....))))).})))..))).))|((((.(((......))))))).{(((...(((.(,{(((..((((((...((.(((((.......))))).)))))))).))))))))))))).)))))))..)))))))||||||}..|||||||..|||{.,}|}},)))},,,|||,{{((((({..((.((((.((((((({{.,..{(({.,,{,||,...((((|{(((((,,,}}|||}...}||}.....{(({{..........}}))}....,||.(((((......)))))}|||((((((..((((.(((.....})),))))..)))))),,.,{||,..||....},....}}}}....(((((({..({......}})))))))...,))))))))),)))).}}...,{||,,},))))..|,{{{{{{{{...))}}}))}.,...},,}||||,,,...}})))}(((.(((((.....((((........))))....))))))))....{(({.((..((....))..)).}))).|||{{{.((((......))))..}))})}...........)
Forensic Context
No forensic context available.