Basic Information

Symbol
hsa_SMARCA5_0004100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCA5_0060
Host gene
SMARCA5
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:144449736-144466736 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:143528583-143545583 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-357.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -383.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 380.40
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((.....((((...((((((.(((....))).)).........))))...))))))).).))))(((((((..((((....(((.(((((((.....))))..))).))).......))))..)))..((((((((((((((((.......)))..)))..)))))))))).....((((((.(((((((...(((((((.((((((.(((((((.((.((((...((((...((((((...(((((((((((......)))........((((((((..(((..(((...)))..)))..........(((((.(((...(((((.(((((((..((((((..((((((((((((((.......(((.(((..((((.(((((...((((((..........(((((((..(((((((...(((((((((((((...((((.(((((.......((((((....)))).))..(((....)))......)))))..)))).....)))))))....)))))).((((...))))....(((.((((((((....(((((.(((.....)))..)))))..)))))))).))))))))))...)))))))..))))))....))))).))))..))).)))((((.(((......))))))).((((...(((.((.(((..((((((...((.(((((.......))))).)))))))).))))))))))))..)))))))..))))))))).))))..)))))))...((((.((((.....)))).)))).)))))....)))..)))))))))))))....))))))))....((((.((((((...))))))...)))).....(((((..........))))).....((.(((((......)))))))....)))))))))))))).)).)))))))...))))))))))))))))......(((((....(((((..(((((...(((((..((.((((((((.((....)))))))))).......))..)))))((((......((((((((((((.((((.......((((........))))(((.(((((.....((((........))))....))))))))....((((.((..((....))..)).)))).((((((.((((......))))..))))))...........((......))..((.((((......))))))................))))..))))))))))))......)))).)))))..))))).((((.....))))....))))))))).))))))..........((((((((((..((....))..((((((..((((.((...........)))))).)))))).((((((...)))))).))).))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({(,,.,,,.((((,,,({{.,(.{{{....||,..,..,,,...||{||,..}}||})),}..}}}{{{({{{,.{{{||||||,((((((((({.{(({{({..,||,,,,..,.,,.))))}}).,..((((((((((((({((.......}},..)))..))))))))))....}}}||}}}}}{{{{{{.,{{{((((.(((((({((({{({.((.,,,{..,((((,{{(({,{..,,(,(((((,(((......))).}}}}}..|||||||,}}|||..{{,...)))..}))}}}}}}...,|{|||,{||..,|||||.(((((((..((((,,,,((((((((((((((.{.....{((.(((..((({.(((((...((((((.{{{{..,{{,((,,.,}},,|||.|}}},{{{{{(((((((...((((.(((((...,,,.,,((({....}))).}},.(({....}))......)))))..)))).....)))))))....}|}},,.,|||...,{{((((.(((.((((((((....(((((.(((.....)))..)))))..)))))))).))).))))))....,,,,,,..))))))....))))).})))..))).))|((((.(((......))))))).{(((...(((.(,{(((..((((((...((.(((((.......))))).)))))))).))))))))))))).)))))))..))))))),),))))..))))))).,,((({.((((.....)))).})))})}}}}..,,}}}..})}}))})))))}.}})))}}||||....{|||}}|||||}}}),}}},,,.,)))}}}}{,{(((,.........||}||.....{{.(((((......)))))}}||,{||||,}||||,|||.,}.,)))}))}}.}))))))}}|||(((((({...(((((....,{(({..{{{||,..{{,,,...|.(((((((({{....})}}})))))}...,..,||{.,.,))||,,,,,,,.((((((((((((.((((.......((((........}}}}(((.(((((.....((((........))))....))))))))....{(({.((..((....))..)).}))).||{{{{.((((......))))..}}}}}}.............,}},,})}..{(.((((......))))))................))))..))))))))))))......))}|{|||||.,||,((((({{.....}},..))))..}}))))})),},,.,.........))))))))))))}.|||{{{{({{{{{,.,,,,.,,......}}}..))))))}}.,,,..{(((((...)))))}..}}}}}}}}}).))})
Forensic Context

No forensic context available.