Basic Information

Symbol
hsa_SMARCA5_0005400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCA5_0068
Host gene
SMARCA5
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:144461516-144469293 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:143540363-143548140 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-269.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -295.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 322.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...((.((......)).)).((((.....)))).((((((((.(((((............(((((..........)))))........(((((......))))).((((((((((((.(((((......(((((.((((.((.((((...))))......(((((.((.(((((..(((((...(((((..((.((((((((.((....)))))))))).......))..)))))((((......((((((((((((.((((.......((((........))))(((.(((((.....((((........))))....))))))))....((((.((..((....))..)).)))).((((((.((((......))))..))))))...........((......))..((.((((......))))))................))))..))))))))))))......)))).)))))..))))).))......)))))....)))))).)))))(((((.(((............((((((((((((...((((((..((((.((...........)))))).)))))).((((((...))))))........((((((...)))))).))))))))))))(((((..........)))))............((((((..........))))))(((((((..........(.((((((((...........)))))))).))))))))....((((((..(((((....))))).))))))...................)))))))).))))))))))))......((..............)).....)))))..)))))....))))))))..((((((((((((...(......)...).)))))))))))..((((...(((.((((((((((.((((((((((....((((......))))..)).(((((......)))))..............(((.......)))..(((((((..........(((((((((................)))))).))).......((.((((((((...((((....((((......))))....)))))))))))).)).)))))))((((((........))))))))))))))..)))).)))))))))...))))..)))((.........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.{{(,.,,.{{{{{(((||.{{{{....{||||{{({(({{{,|||||....||,.,...,||||...,,.....,,}}}.,,,}{{.(((((......))))),},,((((((..((((.(((.....})),))))..)))))).{{{(((((((,...(((((.....{({{.,{{{|{,..{{,.....|.{((((((({{,...})}}})))))}...,..{{{{.,.,))||,,,,,,|.((((((((((((.((((.......((((........}}}}(((.(((((.....((((........))))....))))))))....{(({.((..((....))..)).}))).||{{{{.((((......))))..}}}}}}.............,}},,})}..{(.((((......))))))................))))..))))))))))))....,,}}}|{(||((.{{|.((((({{.....}},.,))))..}}))))))),|,,,,|,.......)))))))))|||||||||}}}||||,,.}||,,.||}({,,.{,....{||||..|||||.((((((...)))))}......,,((((((...))))),,)}..,((((.(((((.....))))).))))..............{(((((........,.}))))|(((((((..........{.((((((((...........)))))))).})))))))..,,.,{{||..(((((....))))).}))}}|,||||,,,||..,,,....||||||,,{{.,..{{({.................}))).....)}..}))))}.....{(((({..{{,.(((..((((((((((((...{.,....}...}}))))))))))).))).,}})))))}{{{{{{{{{.((((((((((....((((......))))..}}.(((((......)))))..,.....,||...(((.,.....}}},{((({(({..|||,....|||{{{{{{.....,..........}))}}}|||}.,.,,,,{{.(({{{{{|..,{{{{....{(({......}))}....})}}))}}}))),}}.}}}}},,{(((({........))))},)))))))).,))))))))))))))}}})))}..,))}}}.....,}}))
Forensic Context

No forensic context available.