Basic Information

Symbol
hsa_SMARCA5_0007800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCA5_0045
Host gene
SMARCA5
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
4:144469737-144470931 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:143548584-143549778 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-272.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -297.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 315.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((.((((((.....((((((.....(((((.(((((.......................)))))...)))))(((((((((...((.((((....................)))).))...)))))))))((((((....((((((((........)))))))).......)))))).))))))......))))))...(((...(((((((((...((((....))))..)))))))))....))).(((.((((.....((((((........))))))....)))).)))........(((((((((((((........((((((....))))))......(((((.....)))))....((((((((........))))))))....))))))))))))).))))))))))))(((((...........(((.(((((.((((..((((......)))).)))).))))).))).(..((((((((((((((((........))))))))))..))))))..)...((.((((...((((...))))..)))).))...............(((((....((((((((((...)))))))))).)))))............(((((((((.........(((((((..........(((((((......)))))))))))))).............((((.((((.((((((((.((((((.....)))))).................(((((..((((((.(((((((((....)))))))((((((....))))))..)).))))))..)))))....((((((((.(((.(...((((.(((..((((((((((((((......)))))).)))))))).((((((......)))))).......((((((((...(((((((....)))))))...)))))).))..((((((............(((((.(((..(((.(((..(((....(((...((.....))....)))....)))..)))))).....)))))))))))))).))).))))...).))).)))))))).............))))))))))))))))((((((.................)))))).....(((((......)))))........)))))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((({{{{.((((((..,,.((((({...,{(((((.(((((.......................)))))...)))))}|((({{{{,||{(,{(({....................,,,...,,,,}}||||||,|||{||.,.,(((((({{.....,,,))))}}}}.|||...})))}}.))))))......)))))),,.,,||||{((((({{{,..,{{{,,..,},}}}})))}}}}|,,,,|||{((({(((({{{{,((((((........)))))}....||||{|,,...,...,(((((((((((((........((((((....))))))......(((((.....)))))....((((((((........))))))))....))))))))))))).}),,,})}},,)|||||.,,,,}}}}}...,}|||||,,{||,,{{{{,,,|.,}})},,)))}}|||},,.}}},.((((((((((((((((........))))))))))..}))))).,},,}||.((((...((({...}}}},.}}||,||...,,........,}|||{|,...((((((((((...)))))))))).))))}...........{(((((((((.......,,(((((((..........,|{||||,,,,,.}}}||||||||}||......,.,||.|||||||{(,,((((((((.((((((.....))))))......,,,....,}}}(((((..((((((.(((((((((....)))))))((((((....))))))..)).))))))..)))))..{,((((((((.(((,(,..((((.{{,((((((((((((((((......)))))).)))))))))((((((......)))))),,,,...((((((((...(((((((....)))))))...)))))).))..{{,,{{,,,,........{((((.{((..((,{(((.{(((..,.({{.,,{{.....}),...})).}}})))..))))}}....,))|))))},,,|||..},.}))}...),))).)))))))),,,,.,,,.....)))))))))}}}}}}||||||{..{,,...,........))))))}....{((((......))))),,......))))))))))}})).
Forensic Context

No forensic context available.