Basic Information
Symbol
hsa_SMARCC1_0002400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0065245
hsa_circSMARCC1_076
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47651556-47734790
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47610066-47693300
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-523.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-557.35 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
482.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...(((.......(((((((......)).))))).....))).)(((..((((.....((((((..(((((((....((((.((.((((((.................))))))....((.((((((((((((((((((((((((((((.((((.(((((.(((((((..((((((((((...(((....(((((((.((((.....))))))))))))))...))))))))....))..)))))(((((((.....)))..)))).........(((((..............)))))((((.........))))..)).)))))...))))....))))))).)).......((((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((....(((.(((.((((.......)))).))).)))((.((((..((((((((.((.(((.(((...(((..((((.(((((....)))))........)))))))))).)))...)))))))).))..))))))..((((....))))..)))))))))......)))))))))).)))..)))))).)))))..(((((((..........)))))))..)))))))))....).))))))))).))))))))...)))).)))..............(((((((((.((((((...((((((........(((((((((((((.........))))))(((((((.((.((.(((((((((((...((..(..((((............(((((((.((...((((((....))))))........)).)))))))))))..)..))))).)))))..........))).))))..))))))).(((......))).......)))))))..........))))))....)))))).)))))))))(((((((((((((((((((((.((.(((...((((........))))))).)))))).))).....((((..((((((.((.....(((...(((((.((.((((((((((.....((.((..(((((((....(((((((.....((((...))))....(((((.((((((((((((..(((.(((....((((((.....((.....(((((....))))).....))......)))..((.((((.....)))).)).((((....))))..........(((.........((........)).......)))........................((........))......(((.(((((((............((((............))))............)))))))..))).................((..((((...........))))..)).....((((((...))))))...)))...))))))))))))))))))(((.....)))(((...(((((......)))))...)))..........)))))..((((.((((((.(((((.((((....((....))....))))))))).....((((((....)))))).........)))))).))))..((((.......)))).......)))))))....)))))))..)).))(((.....(((((..(((....((((..((..(((........)))))..))))...((......))...((..((((((...((((...((((......)).))...))))..))))))..)).)))..)))))......)))....)))))))).)).)))))))))))).)))))).)))).......))))).)))))))))....))))))....)).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,,,(((.......{{{{(((......))}|||||..,,.}}}.}||{,,||||.....((((((,,((,{{{,....{{{{|{,.((((((...........,.....))))))....({,(((({{{{{{|||||{{{{{{(((((((.{(((.(((((..((((((..((((((((((.,.{({...{(((((((.((((.....))))))))))))})...)))))))),...})..)))))}{{{{((({,((,...((((.........))))}))})},}},......,|||,{{,{,,,......,}}),,,}.))))),,.)))}....))))))).}}.......{{{{{|||,|||,|{(((({{{{(((.(((((((((,..{(((.(((.(((({,....,)))),))).)))|(.((((..(((((((({{{.{{|,(((...(({.,((((.(((((....)))))......,.)))))))))}.}}}...}})))))).))..))))}...((((....)))).,))))))))).}},.,))))))))||,|||..}}||||,|||||..(((((((..........)))))))..}}|||}}}}.,..|,}}}}}}|||.}},,,|}},,.|||.,|}}..,......,,,,.{{(((((({.((((((.{{((((((......,.((((((,((((((.........))))))(((((((.((.((.(({{{{({{({.,{,{..{,,.(({{,,{..|,|,,,(((((((.,,...((((((....))))))........,}.))))))),}},,.},.}},)},)}))),...,}}...))).))))..))))))).(((......))).......}}))))),,}}......)))))}.,,.)))))).}))))))))||||||||||(((((({{{{{.,({(((,{{(((({,..,...,))})),.,|||||.||,.,,,,((((..((((((.((,.,,.{{{...{{(({{((.((((((((((.{...((.({..(((((((....(((((((,{,..((((...}}}}},,}{{|||.((((((((((((..(((.(((....((((({.,...((.....(((((....))))).....))......)))..((.((((.....)))).)).((((....))))..........{({,.........{........||{......)))........................{{........}}...,,.(((.(((((((............((((............))))............)))))))..))).},,.............((..((((...........))))..)).....((((((...)))))).,,})),,.))))))))))))))))))|||.,.,{||((((,..(((((......)))))...|}||,.,.........}}..{|||.||||||,{((({{((((....,,....}}....))))))))}.....((((({....)))))).,,},....}}}}}}.}}}}.,(({{.......)))).......)))))))....))))))).,)).)){((.....(((({..{||,...((((..({.{(((........)))))..))))...||.....,}....{(..((((((...((((...((((......)).))...))))..))))))..)).|}}..}))}}..,..,)))..,.)))))))).)).))))))}}}))).)))))).))))...,..,)}))},}))))))))),..}}}})),,,,,),)))))
Forensic Context
No forensic context available.