Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0020500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0065282 hsa_circSMARCC1_034
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47721927-47779600 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47680437-47738110 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-253.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -274.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 238.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((..(((..(((((..((((((.....))))...))..)))))...(((((.....(((((((..(((...(((((((.......((((..(((...((..(((((.((((.(((..(((.....(((((.((((...........................)))).)))))...........((((((((.(((...((((((.....((((((((((((.((((((((....(((.((.....)).)))..((((...................(((((((((..((.(((((.......)))))...))..)))))))))))))(((....)))..(((.((.(....(((((((((.((((((.((((.......((((((...)))))).....))))..))))....))..)))))))))....).)).))))))))))).)))).))))))))......))))))...))).))))))))...(((((((.......................)))))))..................(((....)))..(.(((....))).)....(((((((((.((((((.(((.....((...........)).....))).))))..((((((.......))))))..)))))).)).)))))).))).)))).)))))....(((...)))......))...))).)))).......)))))))..........(((((...)))))...........................(((......)))((((((.((......)).)))))).((..((.(((((.(.........((((((((((((((.................))))))..(((((((((......)))).....)))))(((((.((((((((((..(.......)..)))))))))).)))))(((((((.((((.....))))))))))).......)))))))).....).))))).))..))))).)))))))....)))))....)))..))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((({(((,..,,,,,}}||||{{,.,...|||,..||..}}|||{..(((((.,...(((((({..,,,,{((((((((..,....||||,.|||...,,..(((((.((((.(((..(((.....(((((..((((((......,{,...{{,.||......,}},,}}.|{,...,,{,.,.((((((((.(((...((((((.....((((((((((((.(((((((({,..{{(.((.....}}.))}..|,,{,.,................(((((((((..((.(((((.......)))))...))..))))))))).{||({{.,,..,,,,,{{.{{,|,...{(({{{{{({{{{{{,,((((.....,,{,||||.,}}}}}}}.,...))))}})))),},.}}..,})})))})..,})}})...))))))))).)))).))))))))......))))))...))).)))))))).,.|||||||..,}.....}}...)))))}))))).||||........,.},}.....(((....)))..|.(((....))).|....|||((((({.{{((((.(((.....((...........)).....))).)))).},|||||...{{{.,||},,..))},))},}.,,.))).))).)))).)))))....,,...,|||......)),,.|||.,}},,,,....))))}}},,,}...,..(((({...})))).,......,,,...,,.......,...(((......)))((((((.((......)).)))))).{{..((.(((((.(.,,......((((((((((((((...........,.....)))))),.{((((((((......)))),..,.}))))|((((,((((((((((..(.......}..)))))))))).))))|(((((((.((((.....))))))))))),......))))))))..}..).))))).))..))})),)))))))....)))))..}))),.,)))),.....
Forensic Context

No forensic context available.