Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0001700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCC1_0376
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
3:47650036-47663831 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47608546-47622341 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-517.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -556.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 498.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((((((((................((((.((((((.(((((.((((....((....))....))))))))).....((((((....)))))).........)))))).))))..((((.......)))).......((((((((.....))))).)))...((((....((((....))))((((........))))..((((..((((..((((...((((.((((((.(((((((((((((.......(((((.((((((((((..(((((...((.((((((.((....)).))..)))).)).((((((.(((((...)))))..((((((.((.((((.....((((((......((((.........))))......(((((((((...((..(((((((.....((((((((..(((((........(((((...(((((((((((((((((((......))))))....))))))))....)))))..(((((((...........))))))).....((((((.(((........)))..))))))..))))))))))..))))))))...((.((((((.....(((((((((((((((...(((((.(((((..............))))).)))))(((((((((.((....((...(.((((......)))).).))...)).))))))))).......................)))))))..)))))))).))))))))(((((..((...........))..)))))((((........))))...((((.((((((.((((((..........(((.((....)))))...((((((......((((((..(((((((((((....((((((..........)))))).))))))))))).)))))).((((........)))).............))))))((((((((...))))))))(((((((.(((((((((((((.((.......)))))))))..))))))...))))))))))))).))))))))))((((((..(....)..))))))....)))).)))..))....)))))))))........))))))....)))).)).))))))...........))))))..((((..........))))..(((.......))).....)))))...)))))))).......(((....)))..)).)))))...(((((.........(((((((.............(((((((((((((.(((.......(((((.....))))).........))).))))...)))))))))............((((((..((..((.....))...))..)))))).....))))))).........)))))..))))).)))))...((((((..........(((((........(((((((.(((....(((((.((((...)))).)))))..))))))))))........))))).........))))))...........((((.(((.....))).))))......................................((((...)))).))))))))))))).))))..)))).))))........))))))))))))))).....(((..(((((...................)))))...(((((.((((....)))).)))))((((.......))))........((((((((((.........((((((((.((((.((((((((((((......(((..((.((((..(((.....)))..)))).))..)))...))).))))).))))))))..))))))))........)))))))))).......)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,....((((((((((((((((((((((({....((((((((.,.,,(({{.(((,,,.....}}}.}}}}...{((((({....{(((({....|})))},{{{({,,,,(((((((,..(((((((((((,.,,{{,{{{{{..,{{(((,,{{((({{{..{{(...,(({....((((....)))}..((((..(,.,(((........)))))..))))...}}}..}}},}}}}))..((((((...((((...((((......)).))...))))..))))))((((((((.((.(((.((((((((....,(((.(((((...)))))...}}}..,,,..,..,.,(((.{{...,,.,,}}||,,....{{{{.,,.,,,...,...))),.))))..,))))))))))).))....((((.{((((........))).}})))).....))))))))((({......))))((((((....))))))||||...{((((((.,.,....,.,))))))}..,|||{((((.(((........)))..)))))}..))))}.,,)))))))))))))),,,|}}}})),,...{(((((({{{(({{{,,.(((((.(((((..,........,..))))).)))))(((((((((,((..,.{(...,.((({......}))).}.})...)).}))))))))...........,,,......,,,)))}})),,}))}}}},..,,,,((((((({{...,((((,({(,(((,..,((,...})).,}}),))}}))))))))))))...,.,||{{{{,.....,{{{.((....))})),,,,....))}}}},((((((..((((((((({{..,,.(((((..........)))))).))))))))))).))))))}))))))))))).)))})))))))))))))}.....((((((((...))))))))(((((((.(((((((((((((,{(.......))}))))))..})))))...)))))))....(((({{{{{(((((((((({{{{{{,,..,,})))},..(((((({.....(((((.((((((.,,.....,,.,,,...,},,,{|{((({{,,...,))})})).)))))))))))...({,{.|,,|.....|{|}||,{,,...((((((((.....}).)))))).....,|||||},,.,,,,)))))))|,,(((((,........{((((((.............(((((((((((((.(((..,....(((((.....))))).........))).))))}..}))))))))..........,,|{{({(..{{,{{,...,.,||,,|}|.}}}}}|.....})))))}..,......}}}}}.....,,.({{{{...((((,,{{{{{{,,..,{|||}}}}}}}},,}}|||,||||}},..,|||{{.{((((|,{,(({{(({{,,|,,,}}|||.......,,,,..........,,,,}...........{(((.(((.....))).))))....................................}}}))))})))}.,,)}})).})}..}))))}}}).)))),)}...)}..))))),)))))))))).....{{{..{((((...................})))}...{((((.((({....)))).))))}((((.......)))).......,((((((((((.......{.((((((((.((({{((((((((((({......(((..((.((((..(((.....)))..)))).))..)))...))}.))))).))))))))..))))))))........)))))))))},,.....)))
Forensic Context

No forensic context available.