Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0012900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCC1_0321
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47703824-47762225 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47662334-47720735 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-416.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -441.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 324.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((((((((.(((((((((........(((((((((..((.(((((.......)))))...))..))))))))).((((((....((((((((.((.(....(((((((((.((((((.((((.......((((((...)))))).....))))..))))....))..)))))))))....).)).))).......)))))...))))))....(((((...)))))...))))))))).))).))))))))).......(((((((((.((..(((((......(((..((((((((((.(((....((((((.((..(((.........((((.((((..(.((((...............)))).)..))).).))))..((((((((...((((....(((((((((.(((.((.......(..((((..........))))..)(((((.(((((............(((((.....)))))..(((((...)))))...........................(((......)))((((((.((......)).)))))).((..((.(((((.(.........((((((((((((((.................))))))..(((((((((......)))).....)))))(((((.((((((((((..(.......)..)))))))))).)))))(((((((.((((.....))))))))))).......)))))))).....).))))).))..))..((((((((((.....(((..((((.(.((((((((((((.(((((((((.........))))...(((.......))).......))))).))))))...((((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((....(((.(((.((((.......)))).))).)))((.((((..((((((((.((.(((.(((...(((..((((.(((((....)))))........)))))))))).)))...)))))))).))..))))))..((((....))))..)))))))))......)))))))))).)))..)))))).)))))..(((((((..........)))))))...((((.........))))..(((((((((.(...(((((.(((((.(....((((((((...........)))))))))))).)).)))))....).)).))))))).........))))))..).))))..))).(((......)))...(((.((((....)))).)))((((((.((...((((((....))))))........)).)))))))))))))))).)))))))))).)).))).).))))))))..)))).)))))))).....((((.(...........).))))...)))..)).))))))))).))))))))))...)))....))))).)).)).)))).)))(((((.......))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((((((((.(((((((((........(((((((((..((.(((((.......)))))...))..))))))))).{(((((.,,,{(,,{{((.((.(....((((((((({(((({,.((((.....,,((({{{..,}}}}}},...,)))),,)))),...|}..}))))))))....).)).))).......)))))...))))))....(((((...)))))...))))))))).))).))))))))).......((((((({,.{(..(((((......(((..((((((((((.(((....((((((.((..(((.........((((.((((..(.((((...............)))).)..))).).))))..((((((((...((((....(((((((((.(((.((.......(..((((..........))))..}(((((.(((((.....,,,...,(((((.....}}}}}..(((((...})))).,,.....,,,...,,.......,.,.(((......)))((((({.((......)).}))))).{{..((.(((((.(.,,......((((((((((((((...........,.....)))))),.{((((((((......)))),..,.}))))|((((,((((((((((..(......,}..)))))))))).))))|(((((((.((((.....))))))))))),......))))))))..}..).))))).)),,}}{,{(({{{{(((.....{{{..((({.{.((((((((((((.(((((,,,{.........}|||,,.{{{....,..))}.......))))).))))))...((((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((,..{(((.(((.((((,,....,)))),))).)))|{.((((..((((((({,{{.{{{.(((...(({.,((((.(((((....)))))......,.)))))))))).})}...)})))))).))..))))}...((((....)))).,)))))))))......)))))))))).)))..)))))).)))))..(((((((..........)))))))...,({,.....,,,,||,...(((((((((.{.,.(((((.((((,,(....((((((((...........))))))))))))},).)))))..,.}.}}.))))))).,}}}..,,))))))..},))))..})).|{{|,,{{.||,|,.{,..{|||}.},,))).})}(({({{.,,.,.((((((....))))))...,.,,,}}.)))))))}))}}}))}.)))))))))).)}.})).).))))))))..)))).)))))))).....((((.{...........).))))...)))..)).))))))))).))))))))))...)))....))))).}).}}.)))).))}(((((.......))))),,,..
Forensic Context

No forensic context available.