Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0019100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCC1_0289
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47719688-47777616 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47678198-47736126 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-260.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -281.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 294.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....)))(..((((((...((((((..(((((((..........(((((.((((...........................)))).)))))..........))))))).((((((...(((((((((...((((.((((..(((((.((.......)).))))))))).))))...)))).........((.(((((.((((((((((.(((((.......)))))...))...(((((((((((...(((..(((((((((((..(((((((...(((...((((.((((.........))))((((((((((....(((.((((((((.(((((.((((((.....(((.(((((((.(((((((...((((...............))))...))))))).)))......)))).)))....))))))....)))))..))))))))..............(((....)))..(.(((....))).).((.(((((((((.((((((.(((.....((...........)).....))).))))..((((((.......))))))..)))))).)).)))))........((.((((..........))))..)).(((...(((.....)))...)))...............(((((...))))))))...))))))))))...........(((......)))((((((.((......)).)))))).....((.(((((.(.........((((((((((((((.................))))))..(((((((((......)))).....)))))(((((.((((((((((..(.......)..)))))))))).)))))(((((((.((((.....))))))))))).......)))))))).....).))))).))((((((.((....((((.........))))))))).)))........))))...)))..)))))))..)))))))....))))))).))))....)))))))..))))))))))))).)))))))...))))))..))))))..)).))).)....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((....)))(..{(((,{.{,((((((.,(((((((,.,,......(((((.((((..........,.....,..,,......)))).)))))..........))))))}.((((({...(((((((((...((((,((({,,(((((.((.......)).))))))))),)))}...)))).........((.(((({{((((((((((.(((((.......)))))...))..,|{{|{|||{{|.,,{{{,.{((,(((((((..(((((((...(((...((({.((((.......,.)))){(((((((((....{{{.{(((((((.((({,.((((({.|...(((.(((((((.(((((((...((((..,|,......,...))))...))))))).)))......)))).)))....))))))..,,})}}}..)))))}},..............{((,,..}},..|}||(....|}|,,..,.}}}||((((.((((..{,((((....,..........}))}.,..))).),))})((((((.......)))))).{(((,|(,{(.....{{.......{|.{{{|,.,,......}})}..}}.,{{...(((.....)))...}||{{,..,..,,,,,..{{,{,.,,,)))))))...}))))))))}...........(((......)))((((((.((......)).)))))).,,,.((.(((((.(.,,......((((((((((((((...........,.....))))))..{((((((((......)))),..,.})))}|((((,((((((((((..(.,....,}..)))))))))).))))|(((((((.((((.....))))))))))),......))))))))..,..).))))).}}{{((({{((,...((((.........)))))))))},})........})))...}))..)))))))..)))))))}}}.,,)}))}.,.}))))}},))}}}..))))))))))))).)))))))...))))))},)))))),.)}.))).).,..)
Forensic Context

No forensic context available.