Basic Information
Symbol
hsa_SMARCC1_0021700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCC1_0144
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
3:47727539-47728465
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47686049-47686975
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-225.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-244.28 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
251.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(.(((((((((((.((((...(((.(((.......))).))))))).)))))).....(((((.(((...((......((((....)))).......))))))))))....))))).)..)((...(((((.(((((...........))))).).)))).((((((...........))))))((((((((((((((((((.((((((...(((.(((((.....(((........))).....))))).))).)).))))......(((.....)))...((((((.((((....))))))))))...((((.((..(((..((.(((((((((....((((.((((((((............(((((((((.....(((((..((((((((.......)))))).))..))))).(((((((......)))))))...((((((((....(((.((((..((.((....(((.((((((............)))))))))((((((.(((........)))))))))...........(((((...((((((((((((((.......)))))....((((......)))).))).)))))).)))))..)).))..)))).))).)))))).)))))))))))(((((((....)))))))((((((......))))))...((((((...))))))..((((((...................))))))....)))))))).))))....))))))))).))..)))..)).))))..((((((((((((......))))))))))))..(((.....))).))))))))..))))))..)))).((((((.((((((((((..(.......)..)))))))))).))))))((((((.((((.....))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,,.}}|(((,{{(((({((,((((({(((({{..,|||,{|.,,))||,|||||||.|.,,..,||}},{|||....}|||{,,,,)))|,,{,,..,{{||||||||||,,||..,,,.)),,},,))))}))}}.,,,{{,.....,}}}}})})|,..((((.({({{{{.({(.,,((({((,,,,((((.,,{||||.{{{({(.|,(((.(((((.....({(,,,...,}))}.....))))).))).}}},}}).}}}}}}....{{{{|,,..((((((.((({....})))))))))..,)}}}}......,..((.(((((((((....((((.((((((((............(((((((({.....(((((..{({(((((.......))))))}}}..))))).{((((((......})))))}...((((((((....(((.((((..((.((....{((.,{(((({{,{{{{,..,.}}}}||}}}(((((,{(((........))))))))),...,,..,,,|||||..|{{{{{{{{((((({.......))))}.,,,{||,...{{{||,..,,...))))).,,,,,..)).))..)))).))).)))))).))}))))))))(((((((....)))))))((((((......))))))...{(((((...)))))}..((((((.,,..........,..,,.))))))....)))))))).))))....))))))))).||....,........}},((((((((((((......)))))))))))).,|,,.....}))})))|||.{,,||}}},,})))}}||((((.((((((((((..(.......)..)))))))))).)))))||{{,,|}|,||}}}},,)))),,,,)))
Forensic Context
No forensic context available.