Basic Information

Symbol
hsa_chr3_0650200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCC1_0235
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
3:47742146-47743207 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47700656-47701717 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-363.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -382.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 195.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((((.(...(((((((((((((((.((((...((((((((((((((((((((.(((.(....((((.((((((((((((((((((((.((((..(((((((((((((((((((((((((.(((((((..((((((((((((.(((((((.((.((.(((.((((((.(((((((...)))))))((((((((((((((...........)))))..(((((((.....)).)))))..(((.(((.........))).)))....(((((...(((....((((((....((((....((((.((....(((....)))..)).))))......))))....)))))).....))))))))(((((((........)))))))..............((((((((((((((((..(((.(((((((((........)))).)))))))).....))))))))))...........((((.(((.......)))..)))).......(((((...)))))..(((((....)))))..((((((..(((((...)))))))))))(((((.((((((.....((((((((((((((...((((((((((...(((....)))...)))....)))))))....))))....))))))))))...(((......))))))).)))))))...)))))).......)))))))))..(((..((.....))..)))(((((.......((((((((.(((((.(((((.((((((((.((...((((....)))).)))))))).))...)))))....)))))))))))))........)).)))...............)))..))).))).)).)).))))))).))))))))))))..))))))).))))))))))))))))))))))))).)))).)))))))))))))))))))).))))....).))).))))))))))))))))))))...)))).)))))))))))))))...).))))))))))))....)(((((....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,{((((((((.(...(((((((((((((((.((((...((((((((((((((((((((.(((.(....((((.((((((((((((((((((((.((((..(((((((({((((((((((((((((.(((((((..((((((((((((.(((((((.((.((.(((.((({({.{((((({...}})))}|((((((((((((((...........|||||,,((((({{.....,,.)))))..{{,.,{{.}},,,}}.||,.,},....{((((...({{....((((((....((((....,{{{.({....(({....}))..}}.}}}}......))))....))))))..,,.))}))))),||,,,,.....,,,|||}|||,,,{,...,...,,,.|||}|||{((((({.,({,{(((((((((........)))).)))))))).,...})})))})}}..,,,......((((.(((......,))}..)))).{{{{..,,|||,,,}||||..(((((....)))))..((((((,.{((({...))))))))))){{{{,,{,,,,......,,(((((((((((({{.((((((((((...(((....)))...)))....))))))).}}.})))....))))))))||{{.(((......)))..))}),}))))},}},,,,,.......)))))))))}.{((..{,....,))..}}|{(({{.......{{{{((((,((({..{{{{{.,,((((((.((...((((....)))).),)))))).}|{(({.....}})))))}}}))))))...,,}},)),}}}}....,,},......}}}..))).))).)).)).))))))).))))))))))))..))))))).))))))))))))))))})))))))).)))).)))))))))))))))))))).))))....).))).))))))))))))))))))))...)))).)))))))))))))))...).))))))))))))....)(((((....)))))
Forensic Context

No forensic context available.