Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0027500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCC1_0318
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
3:47746282-47748020 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47704792-47706530 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-610.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -641.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 295.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((....(((..((((((((((((.(((((((....)))..((((((((((((((((.......((((.((((..(.((((...............)))).)..))).).))))(((((((.(((......(((((....((((((...........(((((.(((((((((((((.(((.(((((((((((((((.(((((((((((((((..(((((..(((((((((.((.......(((.((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((..((((((..(((((((((((.(((((((((((((.(((.((((.((((((.....((((..(((((((.((..(((((((...((.(((......((((((((((....((((((((.((.......)).))))))))...))))).....)))))))).))...(((((((.(......).)))))))...(((((...((((((((((((((((.((((........)))).))....(((.((((((((((.((((.........))))))))....)))))).)))...((((((((....))...))))))...((((.(((((((....(((((((((...(((...)))..))))))))).....((((((((.(((.(((.((((........)))).))).))).))))))))..((((((...((..(((((.((.(((((.(((................))).))))).)).)))))..))))))))..((((....(((......)))....))))..........((((((((((((..((......)).))))))))))))...........((((((...(((((((.....(((((((....((((((((((....))))).)))))..(((.........)))....))))))).......................))))))).)))))))))))))...))))...............))))))).))))))).)))))........(((((((((...))))))))).....)))))))..)).)))))))..))))......((((((............))))))((((((.((((((.....))))))).......................((((((((...))))))))...((((.(((((((((((((.........)).)))))))..))))))))))))).)))))).)))).))).))))))))))))).)))))))))))..))))))..))))))))..)))))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))).))).......)).))))))))))))))..))))))))))))))).))))))))))))))).))).))))))))))))).))))).......))))))...)))))......))).)))))))....)))))))))))))).))((((((.(.((......))))))))).........................))))))))))))))))..)))((((..((((.(((..((((((..((((((.((((((.((.......))))))))..).)))))....)))))).)))))))..).)))...(((((..(....)..)))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{{(({{..{((({((((((((((((.(((((((....)))..{(((((((((((((({.......((((.({((..,.((((...............}))).}..))).),))||(((((((.{({......(((((.,..((((((...........(((((.((,((((((((((.(((.(((((((((((((((.(((((((((((((((..(((((..,((((((((.((.......(((.((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((..((((((..(((((((((((.(((((((((((((.(((.((((.((((((..........,,,,,{((.({..{{{{{{{,,,|}}},|||.({,((((((((((....((((((((.{{.......)}.))))))))...,}}))..,,})))))..,}}}.,.(((((((.{......}.))))))}.|.(((((...((((((((((((((((.((((........)))).)),...(((.((((((((((.((((.........))))))))}...,))))).)))...((((((((....},..,))))))..,((((,(((((((.,..(((((((((...(({...}))..))))))))).....((((((((.(((.(((.((((........)))).))).))).))))))))..((((((,..{(.,(((((.((.(((({.,{,....,,,,,,.....,))),))))).)).))))),.))))))))...(((.,,{(({.,.,,.}||,.,.}|||||{{{.....{{{{||||||||..||,...,.}).)))))})))})}..,,{{.,{{{(({(({...((({{{(,....(((((((....((((((((((....))))).)))))..{{{.........},,....)))))))....}}......}}}........))))})).)))))}))))))}...)))).,,,...........})))))),})))))).))))).,,,,,..,((((((((...))))))))},,,..|||||,..,||{|,||{{{.{||||{{,,,,{{{{{{,,,||||||,}..,,,.,|}}))}.{{||||,,,,,))))))}}.}}},...............},((((((((...))))))))...((((.(((((((((((((.........)).)))))))..))))))))..,,,,)))))).)))).))).))))))))))))).)))))))))))..))))))..))))))))..))))))))))))},,,})))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))).))).......)).))))))))))))))..))))))))))))))).))))))))))))))).))).))))))))))))).))))).....,}))))),...)))))......})).))))))),,..)))))))))))))).)}((((((.(.((....,.))})))))).........................))))))))))))))||{{|,,((((..((((.(((..((((((..((((((.((((((.((.......))))))))..),}))))....)))))).)))))))..).)))..}||||,.}))))}...})))},,},....
Forensic Context

No forensic context available.