Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0029400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCC1_0311
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:47749876-47750982 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47708386-47709492 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-386.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -406.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 258.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.