Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0035800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCC1_0393
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
3:47777524-47779466 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47736034-47737976 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-808.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -841.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 384.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((........))(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((......(((((...((((((((((((((..((((((...((((.(((((((((((((((((((.((.((((((((((.(((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((((((((((..((((((.((((.(((((((((((....(((((.((((((.(((.((((...........................(((((...........)))))..(((((((.(((((((((((((((((.((((.((((((((((.....((((((((((((((((.((((...(((...((((((((((.(((((.((.(((((..((((((((((((.....((((((((....(((((........)))))........)))))).))))))))))))))...))))).)).))))).)))))))))).)))))))))).))))))).(((((.(((.(.((((((..((((...)))))))))).).))).)))))(((((((..(((.((((((((.(((((......))).)).))))).....(((....)))....((((((((((((..(((((((.....)))))))((((.......)))))))))))))).))...(((......)))...(((((((.....)))))))((((((((......))))).....)))..))).))).)))))))....)))..)))......))))).)))))...........)))).)))).......)))))))))))))...)))))))((((..((((((((((((.....(((((...(..(((((((((((......(((((...(((((...........)))))...))))))))))))))))..)..))))))))))))))............((((((((((((((.((((((((..((...(((.((((.((((....)))))))).)))...))..)))))))).)))).)))...((((((.((.((((((........)))))).)).)))))).)))))))(((((((.....)))))))...)))..))))....)))).).)).)))))).)))))...........(((........))).........))))))))))).)))).))))))..))))))))))))).))).))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))).)))))))))).)).))))))))))))))))))).))))...))))))..))))))))))))))...)))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))((((((.......(((((((((....(((((....((.(((((...(((...............)))...))))).)).....)))))...)).))))))))))))).))))((((((((((..(.((...((((((((....((((((((((((((...(((......))).))))..........((((((((((...((((...)))).((((((((...)))))))).......((((((((..........)))))))))))))))))).....((((((.........................)))))).))))))))))))))).)))...)).)))))))))))..........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((....,,,,|}((((({{((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((..,,,{{{{{,...((((((((((((((..((((((...((((.(((((((((((((((((((.((.((((((((((.(((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((((((((((..((((((.((((.(((((((((((.,,..,{,,.,{{{{({{{,{((((..{{,,.,,,.{{{...,,.{,.....||||,,}}.,,,},..))))}..(((((((.((((((((((((({{{{{((({..,,..,,.,,.....,.((({(((((((((,{((((...(((...((((((((((.(((((.({.(((((..((((((((((((,,,,.(((((,,{....,,,,|,..}}}}},}},,........}}})}}})}))))))))))))...))))).)}.))))).)))))))))).)))))))))).))))|}|.(((((.(((.(.((((((..((((...)))))))))).).))).})))}(((((((..(((.{{{,{{{{.(((((,,....,}}.)),)))),.....(((....))),,,,,,((((((((((..(((((((.....)))))))|(((.,.....)))})))))))))).|||,.((,......|},...{(((({,...}}))|||||,,,(((((......)))))...})))),.))).))).)))))))},}})}},,,,,.......,,,,.}}))}}}},..,,...,,,},,}}}.......)))))))))))))...)))))))..{(((,,{(((((((((.....(((((...{..(((((((((((......(((((.,.(((({,.....,,...}})))...))))))))))))))))..}..})))))))))))))},,,},,,......(({....))}(((((((((((((((({.....(((({{(((....)))))))).||{(((((...{{((,,..((((.((((({((((((.{(.((((((........)))))).)).)))))}{((((|...|))))}.})))))))))..}))).))))))))))))))..)))))))))).,}}}}}}}.....,,.,...,},....,.,....,....))))))))))).)))).))))))..))))))))))))).))).))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))).)))))))))).)).))))))))))))))))))).))))...))))))..))))))))))))))...)))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))){{((((,......(((((((((....(((((....((.(((((...,{(,,.{{{......}}}})),..))))).)).....)))))...)).))))))))))))),)}|}((((((((((..,.,,...((((((((....((((((((((((((.,.{{{......}}).}}}}{,...{((,.(((((((((({,,((,{,,.||||,{,{{{{||,,.})})))},,,,,...,(((((((..{,...,,.)))))))))))))))))).,...,,|||},}},,.............,,......}),},.))))))))))))))).)))...}}.,))))))))))..........)))
Forensic Context

No forensic context available.