Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0038800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCC1_0312
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:47811047-47811850 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47769557-47770360 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-238.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -255.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 250.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((...)))..((((((((((((((((....(((((..((.((((..(((....)))...)))).))..)).))))).))))))))....(((.((((((....)))))))))......................(((((.......)))))((((((((.(((((((((((((.........)).)))))))..))))))))...))))..((.((((((((((.(((((((..(....)..)))))).....(((.(((((((((((((((((((.....................(((((.((((((((...........((((...))))...........))))))))..)))))..(((..(((......(((.((((((......(((....))).(((....))).))))))))).....................((((.....))))..)))..))))))))))))))((((.((((((........))))))))))....))))..(((((.....)))))...............)))).)))....(((((.((.((((.((...(((((.......)))))...)).))))((((.(((...(((((.(((((((........))))))).((((..(((((...)))))..)))).)))))...))).))))(((((((((...)))).)))))........)).)))))..(((((((.......)))))))...(((((((.(......))))))))....).)))))))))).))...))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((...)))..((((((({(((((({{,,..,,,,|,.((,{({{..,((,,,,|||...}|}|.|}..,..),})),)}}))))),,,,(((.((((((....)))))))))....................,.(((((.......)))))((((((((.((({(((((((((.........)).)))))))..))))))))...))))..((.((((((((({((((..,..(((({......})))),,..)))),(((((..(((({{{((((..........{(((((((((((,.(({,((((,,.{{{{.{.{{{{(,,,{{{{|,.....}}}}.}}))),,,))}},,,,)|}|.}}}{||.{,,,,{{{.{{{|||......(((....))).{({,,,,}}|,}}}})))}}..........,.,,,..,{,,(,,,..,{{|}||,{{{,{{|{(((((((((.((((((.((((((........))))},,,,||....|,...(((((.....))))).,|,,........{{|||||}},})}}}}))))))))}||,,,..}|||||.,}}},.}},))},.})}}))}|)}}|}))))}}}}}}}{((((((........))))))),,|,..}||||{(((({{{....}}})}}))}}))}.,}}))}}||||||||..,)))}.}|||||{.,,,.|||,|||}...{{{(({{.......))))))),..{((((({.|......)}))))))..)))))))))))))).))...))))))
Forensic Context

No forensic context available.