Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0039200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SMARCC1_0124
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:47815355-47817444 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47773865-47775954 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1035.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1068.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 296.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.(((((((((((..(((((((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((....)).((((..((((((((..(((((((.....((((((...((.((((((.....(((.((((....................((((((((((...(((((((((((((((((((...))).)))..((((((((((((((((((((.......(((((((.((((((((.((((((((.((.(((((((((((((.((((((((..(((((((.(((((((((((((((((((((((...(((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((...(((((((((((((((((..............))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))..))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))..)))))))))))...))))))))))))))))))))))).)))))))..))))))))))).)))))))))))))))).)).)).)))))))).))))))).))))))))))))))))))))..))))))))))))).))))))))))..........((((((((((((..((.((((((.........))))))((((((....))))))....((((((.(((((((.((((...(((((..((((((......)))))).....((((((.....))))))((((......))))...(((..((((((((.(((((.((..((((..((((..................(((((.....)))))))))..))))..))))))))))))))).))))))))..))))...)))....(((((((...((.((.((((((((.(((....))))))))))).)))))))))))((((((..........))))))............)))).))))))..((((((((((.....))))))))))......))..))))))))))))...)))).)))......)))))).))...)))))).)))))))))))))))..)))).)))))))))))))))))))))))).))))).)))))))))))))))))))))).)))))))))...(((((...(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((..((((((((.((((((((..(((((......))))).(((.(((((((....(..(.((....)).)..).....))))).)).)))........(.(((.(((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((...............))))))....((((....))))...))))))).)))))))))))))))))))))))))))).))))))))).))))))))..))).))))))))))))))).....))))))))))))))))))))))))))....))))).(.(((((.........))))).).................((((.((((........)))).)))).......((((((..((.......))))))))(((.(((...((((((((..(((((((.((((((...((.(((.(.((((..........))))).)))))))).....))).))))))).)))).)))).((((((((..(((((((((((((((.(.(((........))).))))))))....................((.(((((..((((((.((((((((........))))))))..).)))))...))))).)).........))))))))...))))))))))).)))))((...((((...((((((((....))))))))...))))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((.(((((((((((..((((((({(((.(((((.(((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((.((((,,{{({,,.,.,,,.{{{{{{{(((....|}||}..,.,,{,{{(({{.,,.{{((((.((((...((((((((((...((((((((((((({(((((...|)).))}..((((((((((((((((((((.......(((((((.((((((((.((((((((.((((({((((((((((.((((((((..(((((((.(((((((((((((((((((((((...(((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((({..(((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((({,,,{((((((((((((((((((....,.........))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))..}))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))...))))))))))))))))))))))).)))))))..))))))))))).)))))))))))))))).))}}).)))))))).))))))).))))))))))))))))))))..))))))))))))).))))))))))..}))),)))|||{,||.}}}}},},.{(({((.........))))}}{(((((....)))))).....)))).))))))))..)))))))||{{..((((((......}))))}{{...((((((.....)))))),..})},},,,{(((..(((..(((((((,,(((((.((..((((..((((..................(((((.....)))))))))..))))..))))))))))))))).)))..)))}(((((((((..{...(((((((...{(.({.((((((((.(((....))))))))))).))}})))))))((((((..........))))))............,,...)))))))))((((((((,,..{{|||,|||||.{{.,...{{{{|,,,,,,)})}...},)).)))}}.)}})),,))}))}}},,,,,,.,,,}}},,,||||,,..)))).}))))))))))))))))))))))).})))).)))})))))))))))))))))).)))))))))...(((((...(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((..((((((((.({((((((..(((((,....,))))).(((.(((((((....{..(,({....}}.,..},....))))).)).)))........(.(((.(((((((((((((((((((((((((.(((((((,,,{{{...............}}||||,{{.,......})))},,.))))))).)))))))))))))))))))))))))))).)))))))}).))))))))..))).)))))))))))))))}....,)))))))))))))))))))))))))....))))}.{.(((((.........))))).}.............{{{{,(((,....}}}},}}}))...{(({,..|}||,{{{,,..||.}..,,,}}},,,,,(((.(((...((((((((,,(((((((,({(({{...((.((|,(.((({..........)))).,)))))})},....,}}.))))))).)))).)))).((((((((..((((((({(((((((.(.(((.......,))).))))))))....................,{.{((((.,((((({.((((((((........))))))))..}.))))).,.))))),}}.........)))))))).}.))))))))))).)))))((,,.((((...((((((((....))))))))...)))).,,.))
Forensic Context

No forensic context available.