Basic Information

Symbol
hsa_SNX29_0001300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SNX29_0069
Host gene
SNX29
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
16:12091360-12093960 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:11997503-12000103 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1062.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1103.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 557.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((((((..(((((((..((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((((((((.((((..((((.(((((..((..((((((((..((((((((.(((((((((((((.((((((((((.(((((((((.((((.((((((.((((((((((((.(((((.((((((..((((((((((.(((((..((((...(((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((....((((((((((((((.((((((..((.(((.......((((..........)))))))))..)))......(((.(((((..((((((((............(((((.((.(((((((.((.((..(((.(((...((((((.(.(((((((..(((...(((((.....((((((((.((((..(((.((((.(((((....(((((.((.(((((((.(((.(((......)))..))))))))))..(((.(((.(((.((.((((.((((((....)))))).)..))).))))).(((((((((.((((((..((((.((((((...........(((((.(((....)))))))).(((...((((((.((((((((((((((((((((.((((.....((((((((...)))).)))).)))).))))..(((((...)))))...(((.((((((((((.(((((((((((...((((((((((((((((..........)))))))))((((((((((((...))))((((((((.(((..........)))))))))))((.((((((.((......((((((.(((((.....))))).)).((((((.....))))))....))))...)).)))))).))........))))))))....))))))))))))..))))))))))))))))..))).....)).))))))).))))))).....)))))).)))...)))))).))))......))))))))))))))).........))).)))....(((.(((((((...))))))).)))(((((((...(((((((.......)))))))......)))))))(((((.((((...)))).)))))(((((((...))))).))......(((((((....))))))).)))))))....))))).)))).))).((((.....))))...((((..((....))..)))).)))))))))))))))))...)))..))))))).).)...)))))))))))..))(((((((..(((((.....(((((((((((...))))).))))))....)))))...)))))))..(((.((((((...)))))).))).)).)))))))))..)))))...((((((((((((.(.(.(((((((........))))))).).).)))).))))))))..)))))))).))))).))).))).))))))).))))))).(((((((.((((..(((((((....)))))))....)))))).))))).......((((((((......(((...((((..((((..((((((((....(((....))).((((......(((((((....)))))))......)))).(.(((((((((((....))))))))))).).....(((((...(((..(((((....))))).)))))))).(((............)))))))))))..))))..))))......))).........((((((((......(((((.....)))))..........))))))))((((..(((((((.....)).)))))....))))...........((((((..........)))))).((.(((((((((..((((.((((....((((((((.(((((.(((...)))))))).)))))))).........(((..(((......)))..))))))).))))..))).))))))..))..))))))))(((.(((.((((....(((((....).))))...)))).)))..)))...))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..)))))...))))..))))).))))))))))..)))))).))))).)))))))))))).)))))).))))))))))))))))))))))).))))))))))))).))))))))..))))))))..))..))))).))))..)))).))))))))))))))).))))))).)))))))))))))))))))).))))))))))))..)))))))..)))))))))((((((..................))))))......((((.(((((...((((.((((((........(((..(((((((((((((((((((((((.(.(((....))).)..)))))))))..).)))))))))))))....))).)))))).)))).))))).)))))))((((((((.(.((.((((....)))).))).)))).)))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((..(((((((..((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((((((((.((((..((((.(((((..{(..((((((((..((((((((.(((((((((((((.(((((((((((((((((((,{((((.((((((.((((((((((((.(((((.((((((..((((((((((.(((((..((((...,((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((....((((((((((((((,((((((,,((.{{,,,,,,.{((((..........))))),},,..}},......{{{.(((((((((((,((({.,.,,....,,.|,||||({(({{,,,{(({((((({(.(((,(,(((((({({({,(((,.{((({(.,,,,...}}}|||,||||}||...}||,}||,|,,|||,,||,,(((({{{.({((((,.{(({(((.....,|,|{{{{{|,},,||{{|{{{.{{{({{.({{.,,,}||{{{(,..,||||||{{.((((,{((,..((((((((((((((((.{(((({({{{{{......{{,,,(((((.(({....)))))))).(((...((((((.((((((((((((((({((((.((((.....((((((((...)))).)))).)))).}}}|..(((((...))))).,,(((,((((((((((.(((((((((((...((((((((((((((((..........)))))))))(((((((({,(({{.||||((((((({.(((..........)))}))))))),|}||||||.||.,,{||{({{((.(((((.....))))).}}.((((((...,,))))}},..,}))},,,}}.}}})),.)))}}.....))))))))....)))))))))))}.,))))))))))))))))..))).,,,,))}})))))).))))))).....)))))).)))...,})))),})))},,...)))))))))))))))......}}})}},{{{{....||}|((((({...})))))}.}},((((((({..(((((((,......)))))))..,,..)))))))(((((.{(((...)))}.))))){{{({({,{{|,,,..}|......,((((({....})))))|{||||||,.,{{|||||{||,|,||},({((.....})},...,|||.}||,.}}))}})))){|||||||||||,,,,))})})))}}))))))),)})}..)))}},}},,.}}},|{{{|||,,|{({{.....(((((((((((...))))).))))))....)))}}...}}}}}}}.)))|}||||}|}},}}))))},))},),))),}}}))))))}.)}..||||||||||||.|.,|||||||{},.....,))))})}})})))))).,,}},)))}.,,)))))).))))),))),)}}.))))))).))))))).(((((((.((((,.(((((((....))))))).}..)))))).))))).......{(((((((......(((,,.((((,,((((,.((((((((...,(((....}}}.{{{{......(((((({....)))))))......}}}}.{.(((((((((((....))))))))))).,...,,{{{{{...{{{.{(((((....))))).}))))))),|,|,.,.......}})}||})))))}..}))}..}}}),,...||,,......,,.{{||((((,,..,.(((((.....))))),...,,,.,,)))}}}},{{((,,(((((((.....)).)))))....)))),..........((((((..........)))))).,,.(((((((((..((((.((({....((((((((.(((({{(({...}))))))).)))))))).........(((..(((......)))..)))}))).))))..)))},)))))..}}..)))))))}(((.(((.(((({{..(((,,....)}),,)}})}})).)))..)))...))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))}...))))..))))).))))))))))..)))))).))))).)))))))))))).)))))).))))))))))))))))))))))).))))))))))))).))))))))..))))))))..))..))))).))))..)))).))))))))))))))).))))))).)))))))))))))))))))).))))))))))))..)))))))..)))))))||(((((({...,.............|||,||.,....||||.|||||},}||||,{(,(((,...{((.(((..(((((((((((((((((((((((.,.{((....})).,..)))))))))..).)))))))))))))....))).))),},.)))),)})))})),},}|((((((((.{.((.((((....)))).))).)))).))).,)
Forensic Context

No forensic context available.