Basic Information

Symbol
hsa_SNX29_0001500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SNX29_0175
Host gene
SNX29
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
16:12092418-12093215 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:11998561-11999358 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-235.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -253.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 230.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((((((.((((......(((.(((((((...))))))).)))(((((((...(((((((.......)))))))......)))))))(((((.((((...)))).)))))(((((((...))))).)).......((((((....))))))(((((((....((((((((((.((((..((((.....))))........)))).))))))))))((((((((((((....))))).)))))))..)))))))..((.(....(((((((((((((...(((((.....(((((((((((...))))).))))))....)))))...........(((((((((((..(..(((((((((....)).)))))))..)(((((((((((((((((.(.(.(((((((........))))))).).).)))).))))))))...))))).....))))).....))))))...)))))).))))))).....).))(((((((....)))))))...(((..(((((((.((((..(((.(((((((((.(((...)))))))))))).))).........(((....))).((((......(((((((....)))))))......)))).(.(((((((((((....))))))))))).)..)))))).))))).)))(((((....))))))))).)..)))))).......))))(((((((((((((((..((((((((...((........))..))))).))).....)))..)))))))))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,{(((((((({.((((..,.,,{((,(((((({...})))))}.}},((((((({..(((((((,......)))))))..,,..)))))))(((((.((((...)))}.))))){{(({((,{{|,,,,.}}.......((((({....})))))((((((({...{(((((((((.,(((.{(,((,....}},.....,,,,)))),))))))))))((((((((((({....}))))}}))))))}}))))))).,||,|..,|{{{(((,{(((((|.,{((((.....(((((((((((...))))).))))))....)))))...,,,,}}}.{(((((((({(..(..(((((((((....)).)))))))..}{||{||{{|{{{{{{{|,{|{||{{{{((........}}|||||||,}.}}}|,||}||||}..,|}|||,|.,,||}}}..,,.||||||{|||||||,,|||||||{{.{{|{|}{((((((....))))))}.,.,||,,||{||||}||{{,|||,.{{{{{{{{,,{||,,,)))))})))))),})}}}}.},...|||,.,,))),||||,,...,{{{{|{{....}}}}}}}.....,}}}|,|.(((((((((((....))))))))))).,..,})))),)))}}.}}}(((((....))))))))).)..))))))}.......}))(((((((((((({((..((((((((...((........)}..))))).))),....,)}}})))))))))))....)
Forensic Context

No forensic context available.