Basic Information

Symbol
hsa_SNX29_0002300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SNX29_0173
Host gene
SNX29
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:12093154-12146079 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:11999297-12052222 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-148.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -157.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 97.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
............((.(((((((((......(((((.....(((((.....)))))....)))))((((....))))....))))))))).))...........(((((....((((((((.((.(((((.....)))))........((((.(((((..............((..(((.......((((((....))))))......(((.....))))))..))((((((....))))))....((((((((((.(.((.(((.....))).)).).)))))))))).........)))))))))....((((....))))((.(((((...)).))).)).(((.(((((..(((......((((((((((......))))))))))......)))..)).))).))).....(((((.........))))).............(((((.((........))))))).)).))))))))...))))).(((((......)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,.,,...{.{(.(((((((((...,,,(((((...{.(((((.....)))))}...))))),,,,....))))....))))))))).))}..},......(((((....((((((((.((.(((((.....)))))...,{...{(((.(((({..............((..,,..|,,..{((((((....)))))),...,||{{,....|||||,..,,((((((....)))))).,..((((((((((.{.((.(((.....))).)).).))))))))))....,}...)))}))}}}....((((....)))){{.(((((...)),.}},||,{,{{,..,({.(((......((((((((((......)))))))))).,..,.)))}},),|((((((.....))))))},,,,,,...,|||,}|,....,...(((((.((........))))))).)).))))))))...))))).(((((......)))))..
Forensic Context

No forensic context available.