Basic Information

Symbol
hsa_SNX29_0004600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SNX29_0041
Host gene
SNX29
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
16:12126327-12128569 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:12032470-12034712 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-714.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -757.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 384.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((..(((((((.(((....((((..((((((((..(((..........)))..)))..(((.....))).((((((.(((((((((((...........((((.......))))...........))))))))..((((..(((((.(((((((.....(((((.((((....)))).)))))........(((((((((((.......)))))))))))...((((((.((((.((....)))))))))))).........(((..((.(((.((..(..((.....))..)..))))).))..))).))).)))).))).)).((((.......))))...........))))......(((.((((((((.((((...((((((((....(((((((...(((((((...)))))))..........((((((.((((.(.......).)))).))))))..(((((..((......((((..(.((((((((....(((((......)))))...((((((((......))))))))(((((...........))))).)))))))))..))))(((...(((((((..(((.....))))))))))....))).......(((((((..((.(((......))).))..)))).)))((((((((.(((((((((....)))))....(((..(((((((((((((((((......))))))))(((((((((((((.((.((((..((((...........(((((((....))))))).((((((....)))))).....((((((((.((((...)))).......((((((((((((((........(((....((((((((..(((.((((....)))).)))..)))))))).))).))))..)))).))))))..................(((.(((.((((((....)))))).))).))).(((((((((((((........(..((((((....))))))..).......)))))))..)))))).))))))))))))))))))((((((((.......)))))))))).)))))).((((((((......)).))))))...)))))...)))))))))..)))......(((.((((((.((..........)))))).)).)))((((((((.((.......))))))))))..((((((((((((((((((((........(((((.(((....))))))))(((......)))(((((.((((((((((((.(((....(((((.......)))))))).))))..((......))(((((((.(((((((((........))).)).)))).)))))))((((....)))).((((.(((....((((...(((.((((((..(....)..))))))))).))))....))))))).((((...((......)).)))).(((((((...(((((.(((((..((((((...(((.(((((((....((((....))))........(((((...)))))...))).)))).))))))))).((((((((((((((...)))).....((........))....)))).))))))...))))))))))....))))))).)))).)))))))))...(((((((((....)))))))))....((((..((((((.((.((......(((((.(((((......))))).)))))......))))))))))..)))).(((.....)))......(((((((((........))))))))).(((((((((((....((((.(((((((..((((((((((((..(..(..((...(((((.((((((((((((..........((((((((.(((..(((((..................)))))..))).))))))))...))))))))))))....))))).......))..)..)..))))))))))))..)).))))).)))).((((..((((((((.(((.((((.((....)))))).))).))).)))))..))))....))))))))))).))))).)))))))).)))))))....)))))))))))).....))..))))))))))))...))))))))..))))..)).)))))).))).)))))))))...)))))..))))..)))))))))).)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....(((..(((((((.(((....((((..((((({((,,,,{,,.,|,....,}}||||},,,,,.....,}|,((((((,,,{((((((((....,...,,.((((.......)))).},........))))))))..,{{(,,((((,..,.{({(.,...(((((.((((....)))).))))).,......(((((((((((.......))))))))))).,.{,((({.({{{.((,..,||||}},}}}},,,,,...}}}},,,}},}}.(((((...((.....))....))))){{((((((,,.....).)))))).},((((.......))))...,,,...,.}}}}.,..,,(((.(((({({{.{{{{.,,{(((((((....{((((({...(((((((...)))))))..........((((((.((((.{.......}.)))).))))))..{{(((..,{|{....((((..(.((((((((....(((((......)))))...((((((((......))))))))(((((...........))))).)))))))))..))))(((...(((((((,,{(,..,.})),}))))))....)))....,..(((((((..((.(((......))).))..)))).)))((((((((.(((((((((....)))))....{((..(((((((((((((((({......}))))))){{(((({((((((,((.((({..,{||,..........{((((((,...,}))))),||{(((....,))))).....((((((((.((({...}))).....(,((((((((((((((........(,(,,..((((((((..(((.((((....)))).)))..))))))))}))}.))))..)))).)))))),.................(({.((,.((((((....)))))).,)).})}.(((((((((((((........(..((((((....))))))..).......)))))))..)))))).))))))))})))))})}}((((((((.......)))))))),}.)}}}}},{(((((((......)).)))))}...})))}...)))))))))..))}.......{{.((((((.{,....,,,,..}}||}}.}),)}}{(((((((.((.......)))))))))},.((((((((((((((((((((,{{..{..(((({{(((....))))))))..}.}}..,)}((((((.((((((((((((.(((...,(((((.....,,)})))))).))))..,,......,|(((((((.((((,{,,,...,,,..,,),)}.)))).)))))))|(((,...}}},.(((,,(((....((((...({.,(((({{|.|....)},})))))))).))))....))))))).((((...((......)).)))).((((((((..(((({{(((((.,((((((...(((.(((((((....,{{{...,}}},.....,,.({,,,...))})),..))).)))).))))))))).{(((((((((((((...)))).....{{.,......,.,...)))).)))))}...))))))))))..)}))))))).))))},))))))))}..(((((((((....)))))))))....((((..(((({((({,((......(((((.(((((......))))).)))))......))))))))))..)))).|,,.{((({.....))))|{((((((,,......))))))})},(((((((((((....((((.(((((((..((((((((((((..{.,(,.((...(((((.((((((((((((..........((((((((.(((..(((((..................)))))..))).))))))))...))))))))))))....))))).......)),,)..}..))))))))))))..)),})))).)))).((((..((((((((.(((.((((.({....),)))).))).))).)))))..))))....))))))))))).))))).)))))))).))))))).,..)))))))))))).....}}..))))}}}))))).,.))))))))}.))))..)),}))))).))).},}))}})}...)))))..))))..)))))))))).)))...
Forensic Context

No forensic context available.