Basic Information

Symbol
hsa_SNX29_0008900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SNX29_0110
Host gene
SNX29
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
16:12155587-12158190 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:12061730-12064333 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1221.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1263.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 537.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.(.((((((.((..(((((((((((.((((((((((((((((((.(((((((...(((.....))).((.((((((((......)))))))).))..((((.((....)).))))))))))).))).......(((((......))))).((((((..((((((..(.((.((((....................)))).)).)..))))))........(((((.(((.(((((((((((((....((((((.((((......)))).))))))..((((((....(((..((((((((.(((((((..(((......)))..))))..((((((.((((((......))))))))))))(((((((((((....(((((((((((((((((((((((.((.((.(((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((.(((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.((.(((((.(((.((((.(((((((((((((((((((((((((.(((.(((.(((.(((.(((............................(((.(((((((((....))))).)))).)))...((((((.(((((.(((.((((((((((.((((.......)))))))))))))).)).).))))).))))))...(((((((....((.((((......)))).))))).))))...(((((..((((((((((.(((.((((((((((((((...........((((((((.......)))))))).(((....))).(((((.((((((((...)))))))).(((((.(((..(((((((((...(((....)))...)))).)))))........((((((...........)))))).((((...((((((.(((((((((....))))))))).))....)))).....))))..))))))))))))))))))))))))))).)))))))((((..((((((...(((((.((((((...((((.((...(((.....)))))))))....)))))))))))((....))..((((((((..((((((((((.....)))).(((.((.(((((((((((((((((((.......)))))))).))))))))..))).)).)))))))))...))))..))))))))))..)))).(((.(((.((((((.((.(.((((........))))((((....)))).((((((((((.(((((...))))(((((...(((((......((((.(((((((((((((......((((((((.((.....((((((((.(((((.......((((((.(((.(((.......))).))).))))))))))).))))))))...)).)))))))))))))...)))))))).))))...))))).)))))).))))))))))..).)).)))))).)))))).....))))))..)).)))....))).))).))).))).))).)))))))))))))))))))..)))))).)))).))).))))).)).)))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....)))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).))).))))))))))))))))))).)))))))))))))))))).)).)).)).)))))))))))))))))))))....)))))))))))..((((((.(((((((.(((.(((((((.((((((.(((((...((.(((........((((((....(((((((((((.......)))).....(((((((((((....)))).)))......)))).....(((..(((((.(((((....))..))).)))))..))).(.(((((((((...(((((....)))))......(((.((((((((.......))))))))(((((.......)))))))).....))))))))))))))))))))))).))).))))))))))))).))))))).)))...)))))).).))))))....(((((((....((....(((....((((.....((....))........))))..)))....))...)))))))))).)))))))).)))..)))))).....(((((((((.(((....)))..)))))))))))))))..)))))))))))))))..))))))(((((((((((((((((((....))))......)))...((......)).)))))))))))).))))))))).....)))))).)).)))).....)))))...)).)))))).)))))).((((((((((((.......))...))))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((({,(.((((((.(,..(((((((((((.(((((((((((((({(((.(((((((.(.((,(({{{({,.{(.((((((((......)))))))).)}..,{{|,{|},,.)).))),))))))).))).((((.(({{,(((((...))))),}}||.)))){{(((((.{{.|||},,..........,..,,.,,(({{{{{({,...{(({{{,.....{{{{|||||.,{{{{{{|{{{||..,{(((((({{,,,.}}..}))))},)))})..((((((..,.((|,.{{(((((|.{{,((((,.(((......))).,))))..((((((.((((((......))))))))))))(((((((((((....(((((((((((((((((((((((.((.((.(((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((.(((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.((.(((((.(((.((((.(((((((((((((((({((((((((.(((.(((.(((.{((.{({.....................,|,,,,,,,{..{|||,,,{||..,,}||,||{..((((((((....{(....)}))))))))..))..,,,{.......,,)}))}|{.|,|{(((((((.({((,{((.((((((.((..{.(((((.((((.(....(((((((((((..{.((((...))))}..)))}}}))))))..,},))))))))).,...))))))))))}((((.(((...((((.(((...(((((.((((((((.{(((({{{{|||.{.{{.((((((((..(((((((((...(({....}}}.,.)))).)))))......,.(((({,..|,,..,...,}}}}}((((((((.{..{,.(((((((((....))))))))).}}...{{{{(((..({..((((..((.{((,((((({,(((((.(((((((..((.((((..((((((...(((((.((((((...((((.((...(((.....)))))))))....)))))))))))((....))..((((((((..{(((((((((.....)))),(((.((.(((((((((((((((((((.......)))))))).))))))))..))).)).)))})))))...)))),.,)))))))))..)))).))))))))).))))).,,....},}))))),})).)),}}}},.,))..))))))){(({{{{{{...}))),}})}}),},),)))).))))))))))))|)),),},..}}}}}}}))}||||,,.}}}((((((((.(((((.......((((((.(((.(({.......})).))).))))))))))).))))))))))))))))...)))))...))).))))...))).))))......{,((({,{({{{{{......),,))))),}.)))))),,),))}},,)),}}.)).....,,},}}},})},))}.))).))))))))}))))))))))..}))))).)))).))).))))).)).)))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....)))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).))).))))))))))))))))))).)))))))))))))))))).)).)).)),}))))))))))))))))))))....)))))))))))..((((((.(((((((.(((.(((((((.((((((.(((({...{{,(((........((((((....(((((((((((.......)))),....,{{{(((((((....)))).)))......}}}}.....(((..(((((.((({{....}}..))).)))))..))).{.(((((((((,,.(((({....}))))......(({.((((((((.......))))))))(((((.......))))))))...,.)))))))))}))))))))))))).})),))))))))))))).))))))).)))...)))))).).)))))).,,.{((((((,...((,.,,(,{,,||{(((,..,|||....}},,}}..,.)|})|,}|}|,.,,|,..|}}}}}},)).)))))))}.}))..))))))......{(((({||.{((....)))..,,))))))||}}|||{{||}||||,||}}||},,.,,||,,,|||)},)))),,}}|||}}.,}))),,..,,||}||||||.....}}.},},))))))}))})))))))),....}))))).)).)))).....))))).,.}).)))))).)))))).((((((((((((.......))}}..,))))..))))
Forensic Context

No forensic context available.