Basic Information

Symbol
hsa_SNX29_0013100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SNX29_0161
Host gene
SNX29
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
16:12236355-12238969 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:12142498-12145112 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-860.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -909.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 725.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((......))))))).((((.((.((((((((((.((((((((((((((..((((.....))))...)))))))))))...))).))))))))))...)).))(((((.((.((.((((((((((....(((((((((((((.(((((.((.(((.(.((((.(((((.(((((((((((..(((((......)))))...((((((..........))))))(((((.............))))).(((((...)))))........((((((((..(((......))).(((((((........((.((((((.....)).)))))).......))))))).....((((.((((((....(((((.(((.((((((.((((((((.((............)).)))))...))).)))))).)))))))).......((..(((((.((((.(.(((.......))).).)))))))))..))....((((((((....))))))))(((((((((((..(((((..(((.(((((((..((....(((.((((((((........))))).))).))))).)))))))))))))))..)).)))))))))..((((.(((((.(((((...(.((((((......)))))).)(((((...........))))).((((((((..((.((.((..((((.((..(........)..)))))).)))).))....))))))))....)))))..)))))))))...(((((....((....)))))))..)))))).))))..............))))))))..(((((((.(((.......))).)))))))...))))))))).)).))))).)))).).)).).)).(((((((((((((.((.(((((...((((((((((.((((..(((((.((...((((((((......))))))))...))))))).)))).))).((((((.((((((...(((((((.(((((((((((.((........))))))))).))))))))))).......))))))....)).))))..(((((((((((((...((..((.((((((....(((((....((...))...)))))((....)).(((((((((((.(((....(((((((..(((.(((((.(((((.(((.....))).)))))...))))).)))...)))))))....((((.....)).))))))))))))))))))))))))..)))))).........))))))))).....((((((......))))))...)))))))...(((((..((((((((((.((((((((.(((.........((((((.(.((((((((((((((..(.(((...(((((.((....))))))).))).)..)))))(((((((.(((......))))).)))))..((((((.(.((((((((((.(((((....(..(((.((.......)))))..)))))).))))...))))))).)))))).))))))))).).))))))..........))).))).)))))))))))))))..))))).((.(((((....))))))).))))).)).))).))))))))))))))).)).)))...))))))))(((...(((((((.(((((((((..(((((((((....(((((((..(((...)))..)))))))....(((((((..((..((((......................))))..))))))))).((((((.(((.((((((((.........((((((.......))))))..........)))).)))).)))..)))))).(((((((((((.((((((((........(((((................)))))........(((((....))))).))))).)))..((((((((((((.((.((((.......)))).)).))).))))))..)))..(((((((((.....))).)))))).........)))))))))))........((((((.((((..((.((.....)).))..))))((((..(((......(((((((((...((((((((.(((....))).))).)))))...((((((....(((((.(((((((................)))))))...))))).....))))))..........((((.(((((((.((((((((...(((...)))...)).)))))).)).)))))))))))))))))).....)))..))))..............(.((((((((.(((((((..(((((.((((((.((.((((.........))))..)).))))))......((.(((.(((((..((((.(((((((...((((((...)))))).))))))).))))..).)))).))).)).)))))...))))))).....)))).)))).)))))))..)))))).)))..)))))))))(((.....))).)))))))....))))).)))))))).)).)).)))))(((((.........))))).....)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((......))))))).((((.((,(({{{{{{||,|(((((((((((((,.((((.....)))).,.)))))))))))..,}}},))}}}}}}}},..|,.||(((((.((.((.(((((((((({...(((((((((((((.(((((,((.(((.(.({((.(((((.(((((((((((..(((((......)))))...((((((...,......))))))(((((.............))))).(((.((((({({{..,..({{(((,(((({{,{,....{{{{..{{||||{|......,|,{((((({{{{{..,.,,))))}......,,,,|||{....}|}}.,|||}|,,{{((({{.(((.((((((.((((((((.((,......,....}}.)))))...))).)))))},})}}}},)}}}}}..((..{{(({.{(((.,.(((.......}}}.|,))},})))}..})....{(((((((....})))))))|((((((((((..(((((..(({,(((((((..((....(((.((((((((........))))),,)).))))).)))))))))))))))..))},)))))))},,{{{|,||,,,.|||||...,.((((((......)))))).}{{{{{...........})))).||||{(({..,,.||,|{..||||}|,}}|}}}..}})},)))),,)})|||{|,.....,)))))|{({{{((({......)))))...{{(((....{{....},)))))}}})))}....))..{{||,.....,,,,})))),..(((((((.(((.......))).)))))))...)))))))))},).))))).)))),},)),}.}}.(((((((((((((.((.{((((,.{((({{(((((.((({..(((((.((...((((((((......))))))))...))))))).)))).}}).{((({{.((((((...(((((((.(((((((((((.((........))))))))).))))))))))).......))))))....,).)))),{({,{{{{(({{{{.{{((..((.((((((....(((((....{,...})...)))))||....}}.(((((((((((.(((....(((((((..(((.(((((.(((((.(((.....))).)))))...))))).)))...}))))},....|||{,....}},)}))))))))))))))))))))))..))))}}.........})))))}}},,...((((((......)))))).,.}}}}||}...(((((..(((((((((((((((({((.(((,,....,..((((((.(,(((((((((..,,.,,{.((({{{((({({.(((({,{{|,|,.,,},.{{|..{{({,(,(({((...{{{{{|||,{|||,,..(((,,,,|},,||||{,||.||||},..}|}}|,|.,|},..,,},))),}}))),))})))),..,,}))),,))}),,.))))))))).),))))))..,.,,....))).))}.)))))))))))))))..))))).,{.(((((....))))),,.,,}}}.}),)))},)))))))))))))).))}}))...)))))))){((...(((((((,{(((((((({{((,((((((....(((((((..(((...)))..)))))))....(((((((.,((.,((((......,{{,......,,,.,,})}),,,,))))))}.((((((.(((.(((({(((.....,{{,(({{{{...,,..}}}}}}}}))..,.,,)))).)))).)))..)))))).(((((((((((.(({(((({...,,,..{{{{{....,.......,,}}))}})}.......(((((....))))).})))),}}}.,{{,(((((((((.((.(((((,...,.)))).)).))).))))))..}},..{((((((((.....))).)))))}.......,.)))))))))))......{.{(((((.,{((,,{{,({..,..}}.})..)}}}{{{{,.(({......(((((((((...,{{(((({.(((....))).})).}}|||({.((((((....(((((.{((((((................)))))))...))))).....)))))),)),,.....{(((.(((((((.((((((((...(({...}))...))}}))))).)).))))))))}))))))))).....}}}.})),,.........,,,.,||{|||||||.(((((,{,}|||||.,.{{((||,.{|||.........)))}..||,||||||......,|,|||.{((((..((((.(((((((...((((((...)))))).))))))).))))..}.)))).))},}}.|||||...,}})))).....}))),,)})}}))))))},)))))).))),.)))))))))|||.....})}.)))))))....)))})|)))))))).)).)).))))),,,{|..,......)})})}}...)).
Forensic Context

No forensic context available.