Basic Information

Symbol
hsa_chr16_0017600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SNX29_0098
Host gene
SNX29
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
16:12270011-12272101 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:12176154-12178244 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-542.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -577.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 439.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...)(.((((.((.(((((((((...(((((((..(.(((((.(((..(((.(((((.((((((.(((((((((((..(((..(((((...)))))..))).((((.((((.....))))..))))(((.(((((((((.(((((.((((.(.((((.(........).)))))))))...........((..((((((.(((((((.......((.((((((........)))))).))(((((....)))))((((.....(((((((......)).)))))..))))..........((((((((......(((.......))).(((.(((((((((.......)))))....)))).))).((((.(((((.((..(((((((...))))).))..)).))))).((((((....))))))...))))......)))))))).......((((((......))))))))))))).))))))..))..(((((((((......((((.((.........)).)))).........)))))).)))................)))))....)))).)).))).)))....(((((.((((((.......))))))..)))))((((((.....(((((((.......................((((.(((...))))).))((((((((.(.......).)))).)))))))))))..))))))(((((.(((.....)))...)))))..................)))))).))))))))))).(((((.....)))))........(((.((.......)).)))..................(((((((........).)))))).((((((..((((............(((((((....(((((((.((....))..))))))))))))))................................(((........)))..(((((((......((((.....)))).....((((((....))))))))))))).)))).)))))).(((.((...(((((.....)))))....))))).........((((((...))))))............((((((.(..((((((.((((((((((((((.(((((((........)))))))))))))((((((((((..(.(((..((.(((((.((((......))))......(((........)))....(((((((..............)))).)))...........(((...............)))......)))))))..))))..)).))))))))..)))))))))).)))))))))))..))))).)))..))).))))).)..))))).))........(((..(((((((.((((((((((((((((((.........))))))))..............(((((.......(((((((((((.......((((..(((((((((((((((....))))))((((.................))))....((((.((..((........))..))))))..((((((((..((((...............((((.......((((.......))))........))))...............))))))))))))..))).))))))....)))).......))))))))))).....)))))..)))).)))))).)))))))..)))(((..(((((((.......)))))))..)))((((((........((((.((((.(...........).)))).))))..)))))).......((((((.....))))))..))))))))).))...(.(((.(((((((..........))))))).))).).((((...(((...)))...))))..((.(((.....))).))...((((((.....))))))..((((((.(((((((((......(((....((((...))))....))).......(((((....)))))..)))))))))))))))...........)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...}{.((((.((.(((((((((.,.,,{{{,,.{((((((,.,(({{(...|))}|.((((((.(((((((((((..(((..(((((...)))))..))).((((.((((.....))))..))))..........{(((({(((,{{{,,{.(({{.{,.......|,}}|}}}}}}.,|........((..((((((.(((((((.......((.((((((........)))))).))(((((....)))))((((.....(((((((......)).)))))..))))..........((((((((......{{,.......,}}.(((.(((((((((.......)))))....)))).))).((((.((((({{{..(((((((...))))).))..)).))))).((((((....))))))...))))......)))))))).......{(((((......)))))}))))))).))))))..))....,.{{{{.,((((((((((((((((....,...{{{..........{(({{{,......,)}))},,....}}},,,..,,....}))))))))))))))))|}|.((((((.......))))))..{{{{.((((((.....(((((({.,...........,,,,,.....{{{(.(({...}}})).},((((((((.(.......).)))).))))}))))))..)))))),))))..,,}},,,,,)},...,,,,,.......,......)}))))))}}}))))))))).(((((.....))))).....}}}}}}).........,,|},(((({.....(((((({,.(((((((........),}))))).((((((..((({......,,,,..(((((({...,(((((((.((....))..))))))))))))))..,.,,....................}}....(((........)))..(((((((.....,((((.....)))).,...((((({....})))))))))))).)))).))))))((((((.({({((((({,{{|..{{,,{{{{..{...{{{{{.((((((...)))))).,.....,,...((((((.,..((((({.((((((((((((((.(((((((........)))))))))))))((((((((((..(.(((..((.(((((.{(((......}}}}.{({{.((({{,.....,|{{{..,||||||......}}.}.}}},))),,}}...........{{{...............)))......)))))))..)))}..)))}}))))))..))))))))}}.))))}))))))..,,....,,....))})).},.,..)))))})....{{,......}||||||,.,.((((..{.((((((((.........)))))))).,....))))...................,,,,,...........,,(,.((((((,,.((((((...{||||,,}}}}}.}}}}}}.}))))}.}}))))))))).)))))),...}))))))).})))).((((((((((.....,.......((((((....(((((.{{{,(((({.{{.{((({{.......{{{{..{{{({((({{{{{,{|,{{{{{{{{{{.,||,|,,,,,...,),}}..,))))))))),)).,,....,}))))}}))})}}}.,))||{{{{.....))}}}..,,,}})))}.)).))))))))))))))))))}.......)))))))))).{{{.,{,((({,..}}}},)))}|..}},)).......((((((.....))))))..))))))))).))...(.(((.(((((((,,....,}..))))))).))).).((((...((,...,))...))))..((.{{,....,|)).||...((((((.....)))))).,((((((.(((((((((......,,,....((((...))))...,)}}......{((({.|||.,}}},..))))))))))))))),...,......)))))
Forensic Context

No forensic context available.