Basic Information

Symbol
hsa_SNX29_0017100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SNX29_0073
Host gene
SNX29
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
16:12393093-12393783 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:12299236-12299926 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-194.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -205.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 143.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((.(((.......)))))).))((((((((((((((.((((((.((((((((((.((((((((.(((.((((..(.((((((...((((((.(((.....((.(.((((.(((..(((((((..........)))))))......((((.........))))....((((((.(((......))).))...))))(((((.((((((..(((((......))).))....(((......))).((((((((((((....(((.(((.....)))...)))))))).))))))).(((((.((((((((....))))))))...))))).((((((((((....((((((..(((((((((((((.((((...((.((((((..((((..........))))..))))))))...)))).(((((.........)))))..))))))).)))))).............................(((........)))......))))))....))))))))))..(((((.......))))).....................)))))))))))..........(((..........)))))).)))).))).....))).)))))))))))).)..)))).))).)))))))).)))))))))).)))))).))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((.(((.......)))))).))((((((((((((((.((((((.((((((((((.((((((((.(((,((((..,.((((((...((((((.(((..,{,((,(,{{(({(((..(((((((..........)))))))......,.,((((..............))))((,(((,{{,..|||,|}{{{|,,,|||,|,{{{{{,..,|,,|,,,.}})))))))),,|,{.{({,,||,.((((((((((((....{{{.({,.....,)}...})})))))}}}))))),|||||.((((((({....)))))))),,,))))},{(((((((((....((((({..(((((((((((({.((((...((.((((((..((((..........))))..))))))))...)))).(((((.........})))}..}))))))},))))).............................,{{.....,|.}),......))))))....))))))))))..{((((.......))))}.....................,,,,,}}}}}|,........,|,|.....,{{{{,,,,..}))))..,}..,,.))).)))))))))))).,.,)))).))).)))))))).)))))))))).)))))).))))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.