Basic Information

Symbol
hsa_SPECC1_0010300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0000745 hsa_circSPECC1_006 hsa-SPECC1_0001
Host gene
SPECC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
17:20107646-20109225 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:20204333-20205912 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-413.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -442.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 331.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((................((((((((......)))(((((((......(((...((.(((....))).))..)))..)).)))))....(((.......)))......))))).(((((..((((.(((.....(((..((((.((.......))))))...(((((.(((..(((((((...........(((((((...(((..((.((((((...((((.((((((.(.((((((.((((((.........................))))))......................((((.......))))..((.(((.(((((((((((((.(.(((......))).).))..))))))))))).)))))((((.((((.((.((.(((..((((((((((((............((((((...(.((((.(((((((.((((((.......((((.((.(((((((......))).)))).)).))))......))).....(((((((..(((.(....).)))....)))))))...........))).)))........)))))))))...))))))....(((((((((((.((((..((.((((.........)))).))..))))))))..)))))))...))))))))).)))....))).)).)).)))).)))))))))).).)))))).)))).((........)).........)))))))).)))...)))))))........(((..(((((.....(((((((.((((((((.....)))).........((((...((....((((((((.((.................)).)))))....))).))...)))))))).))))).)).....)))))..))).........((((........))))((((((((((.(.((((((..((((.((((...(((((..................))))).(((((((((.((..((...(((......)))...))..........)).)))))))))((((((...((((((...............((((.....(((((((...............(((..(((....))).)))...)))))))...))))))))))....)))))))))).))))...)))))).))))))..))))).))))).))....))).)))))....((((((((((((...............(((......)))..............(((.(((((.......)))))..))).......((((..(..((((....))))..).)))))))))).))))))..))).......))))))))))))((((....((((((((...)))))))).....))))((((((.........))))))(((((((.((((....))))....(((((......)))))......((.((.(((......))).))))...(((((.((.....))..)))))............((.(((((((........)).))))))).)))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((................((((((,({{{...||,....((((((((((((({.,,.(((((((((..(((((((((.(((.(((..,,({{......,))}..(((((((,{(((((...(((((......,,.....((((.(({{...{{{{,|||,,{{{({|.....{(....}|........},|||{|}{{....{{||.||||,(((((((......)))},)}|{{|||...,)))}},,,.........,........}})),)))).)).)}......,.......,,))),,..))))}.,).)))))))(((((((((((((.(.(((......))).).))..)))))))))))))).))).)))))}})))..........))))))))}||.((((((.(((((((...{{{(..,(((((........))))}......((((.(((..((((...{{({......,,{|,...,,.......}}}}.((((((.,,{{(((.{,((((((((((.((((....((((((..,.{((..,(((((..((({.,,}))){{....))......(((((((,(((.((((..{{.((((.........)))).},..))))))))..))))))).))))),}..))),,.)))))).....))))...)))))))))).}|,|,..}}}},.},||........}}.(((.....)))...))))))...))))..)))..)))))))).}))))))....)))))).,))))))))))))))......}}...})))..}})))).{{{(((((.((.................)).)))))....}},(((((((((((....{{..((.{(((..((((((({....,,.{(,{{((..(..{{,..(.(((((((((((.(.((((((..((((.((((...(((((,,,,.....,}}}.....))))).(((((((((.((..{{...(((......)))...))..........}}.)))))))))((((((.{,((((((...............((((.....(((((((...............(((..(((....))).)))...)))))))...))))))))))}.})))))..)))).))))...)))))).))))))..)))))).))))..)..))))}}.........((((((..(((((((..{......,..)))))))..............,{{.....}|||((,,....,)))},(((,,.,{......}}..,.)))....}})))).....))))))))..))}})..})..)}......{{{{{.....)))}}....((((((({...})))))))..,.....(((.....))))))))))))))(((((((.(({{...,))||....{((((......))))}.||,|,{(.{(.(((......))).))})...(((((.((.....))..)))))............((.(((((((........)).))))))).)))))))))))...
Forensic Context

No forensic context available.